微信公眾號(hào)～小明學(xué)習(xí)室，主要分享如何利用醫(yī)學(xué)公共數(shù)據(jù)庫(kù)發(fā)表文章
發(fā)簡(jiǎn)信
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純生信發(fā)文的新技能，同一份GEO數(shù)據(jù)可以發(fā)兩篇SCI
為什么有些人總是能發(fā)好幾篇純生信SCI？因?yàn)槿思艺莆樟朔椒ǎ缋猛环軬EO數(shù)據(jù)可以發(fā)兩篇SCI，具體操作如下： 第一篇純生信SCI可以這樣做： 第一步，數(shù)據(jù)下載處理、合...
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文獻(xiàn)學(xué)習(xí)010--[sc]重癥新冠患者外周血抗原呈遞細(xì)胞單細(xì)胞測(cè)序揭示多種抗病毒免疫過(guò)程缺陷文章代碼見(jiàn)：https://github.com/MelissaSaichi/Covid_scRNAseq[https://github.com/MelissaSaichi/...
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Linux5-軟件安裝Linux基礎(chǔ)課程系列： Linux1-文件目錄操作命令[http://www.itdecent.cn/p/ce0dd642afc8] Linux2-權(quán)限與遠(yuǎn)程管理[htt...
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Linux3-Vim編輯器Linux基礎(chǔ)課程系列： Linux1-文件目錄操作命令[http://www.itdecent.cn/p/ce0dd642afc8] Linux2-權(quán)限與遠(yuǎn)程管理[htt...
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免疫細(xì)胞注釋-1：T細(xì)胞scRNAseq免疫細(xì)胞注釋： 免疫細(xì)胞注釋-1：T細(xì)胞[http://www.itdecent.cn/p/0127c9b380c9] 免疫細(xì)胞注釋-2：髓系細(xì)胞[http...
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生物信息學(xué)常見(jiàn)數(shù)據(jù)格式1. fasta fasta 是一種基于文本用于表示核酸序列或多肽序列的格式。其中核酸或氨基酸均以單個(gè)字母來(lái)表示，且允許在序列前添加序列名及注釋。 特征：2部分--id行和序...
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單細(xì)胞之富集分析-4：分組水平GSVA單細(xì)胞富集分析系列： 單細(xì)胞之富集分析-1：?jiǎn)渭?xì)胞GSEA分析流程[http://www.itdecent.cn/p/00f069cb239c] 單細(xì)胞之富集分析-2：批量...
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單細(xì)胞之富集分析-3：GO和KEGG富集分析及繪圖單細(xì)胞富集分析系列： 單細(xì)胞之富集分析-1：?jiǎn)渭?xì)胞GSEA分析流程[http://www.itdecent.cn/p/00f069cb239c] 單細(xì)胞之富集分析-2：批量...
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文獻(xiàn)學(xué)習(xí)008--[sc]兩篇PBMC單細(xì)胞文獻(xiàn)閱讀1. A single-cell map for the transcriptomic signatures of peripheral blood mononuclear ...
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基因表達(dá)趨勢(shì)分析-1：TCseqTCseq包可以應(yīng)用于轉(zhuǎn)錄組，單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組，ATAC-seq，Chip-seq等的表觀基因組時(shí)序型數(shù)據(jù)分析。該包主要用于不同時(shí)間點(diǎn)的差異分析，時(shí)間趨勢(shì)分析及可視化作圖。 官網(wǎng)...
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使用ggplot2優(yōu)化Seurat繪圖單細(xì)胞繪圖系列： Seurat繪圖函數(shù)總結(jié)[http://www.itdecent.cn/p/95e61f7e834d] Seurat是分析單細(xì)胞數(shù)據(jù)一個(gè)非常好用的包，自帶...
