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  • 轉(zhuǎn)錄組系統(tǒng)進(jìn)化分析

    trim_galore雙端數(shù)據(jù)過濾nohup trim_galore -q 20 --phred33 --stringency 3 --leng...

  • 常用數(shù)據(jù)處理計(jì)算

    將基因fa或蛋白fa序列文件由多行轉(zhuǎn)換為一行awk 'NR==1{a[NR]=$0}NR>1{if(a[NR-1] ~ ">"){print a...

  • windows文件轉(zhuǎn)到linux上格式符^M的去除

    查看自己的文件 cat -A mmgs.txt 去除M,注意:M的輸入方式是 Ctrl + v ,然后Ctrl + M sed -i 's/^M...

  • 通過注釋查找相關(guān)基因并導(dǎo)出基因序列

    查找TPS相關(guān)基因 grep -wi --color terpene.*synthase combined_function_annotatio...

  • 通過基因號(hào)查找對(duì)應(yīng)基因序列

    自己測(cè)序的基因組,需要查找對(duì)應(yīng)基因號(hào) 用awk命令查找對(duì)應(yīng)基因號(hào)及下一行 awk '$0~/PTG008298L/{print $0; getl...

  • 構(gòu)建參考基因組索引

    香榧基因組index構(gòu)建 激活conda環(huán)境 conda activate rna 構(gòu)建hisat2索引后臺(tái)運(yùn)行 nohup hisat2-bu...

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