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gnomAD系列文章總結(jié)(2) -- 《Landscape of multi-nucleotide variants in 125,748 human exomes and 15,708 gen...距離上一篇文章的解讀已經(jīng)過(guò)了一年，我又有機(jī)會(huì)拿gnomAD的文章講組會(huì)文獻(xiàn)分享了（狗頭）（其實(shí)這篇文章六一就寫(xiě)好了，但是當(dāng)時(shí)要發(fā)的時(shí)候簡(jiǎn)書(shū)在系統(tǒng)...
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ggplot2-根據(jù)group給橫坐標(biāo)排序目標(biāo)：不受x軸變量名的影響，用group信息給橫坐標(biāo)進(jìn)行排序 數(shù)據(jù)表：variable（樣本名）；value（值，想畫(huà)箱線圖）；batch_me...
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gnomAD-LOEUF數(shù)據(jù)下載&使用annovar注釋Part1: gnomAD-LOEUF數(shù)據(jù)下載 上一篇文章已經(jīng)講解了gnomAD的flagship paper，文章中新建的評(píng)估基因?qū)Lo...
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gnomAD系列文章總結(jié)(1) -- Flagship paper -- 《The mutational constraint spectrum quantified from variatio...2020年5月，gnomAD數(shù)據(jù)庫(kù)在Nature及其子刊上發(fā)了一個(gè)特刊，共7篇文章（不算評(píng)論和新聞） 特刊鏈接：https://www.natu...
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工具安裝及試用總結(jié)：對(duì)WES數(shù)據(jù)做germline的CNV calling（非癌癥的疾病研究）（未完。。。）
發(fā)現(xiàn)好多CNV calling 工具都好古早。。。安裝和試用時(shí)關(guān)于版本的問(wèn)題調(diào)試比較多。。。所以想把自己遇到的報(bào)錯(cuò)貼出來(lái)，方便后人debug 1...