更多內(nèi)容請(qǐng)?jiān)L問(wèn)個(gè)人公眾號(hào)---KS科研分享與服務(wù)--- 接上節(jié)(跟著Cell學(xué)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析(二):單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序文件的讀入及Seurat對(duì)象構(gòu)建[http://mp.w...
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對(duì)于組數(shù)高于2組的,t檢驗(yàn)不再適用,這時(shí),方差分析適用 單因子方差分析(one-way ANOVA)We use the data,cholesterol,作為例子 完全隨機(jī)...
歡迎關(guān)注”生信修煉手冊(cè)”! 在之前的文章中,我們提到利用網(wǎng)絡(luò)聚類算法可以從復(fù)雜的蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò)中挖掘蛋白復(fù)合體或者相應(yīng)的功能模塊,其中MCODE算法是最常用的挖掘蛋白復(fù)合體的算法...
經(jīng)??吹轿恼轮杏心欠N好漂亮的網(wǎng)絡(luò)圖,偶也想自己畫一個(gè)呢,但是不會(huì)咋整呢? 別急,今天本椒就分享一下用cytoscape畫互作網(wǎng)絡(luò)圖! 看一遍就會(huì)啦。。。還不會(huì)!那就多看幾遍哈...
由于之前提到軟件版本的問(wèn)題,所以以下分享是基于Cytoscape3.7.2的~ step1:導(dǎo)入string_interactions.tsv 文件,法1:load; 法2:...
有一些已經(jīng)做完了GO enrichment, 得到了結(jié)果,才發(fā)現(xiàn)很多軟件都是直接給gene list做富集。如果已經(jīng)完成分析,照樣可以畫圖,代碼如下: 原始文件示例:Anno...
參考這篇ID轉(zhuǎn)換不用怕,clusterProfiler幫你忙這篇詳細(xì)講了無(wú)參考基因組該怎么辦,值得一看 簡(jiǎn)單介紹一下幾種常用的ID:Ensemble id:一般以ENSG開頭...
轉(zhuǎn)發(fā)自http://crickcollege.com/news/169.html 寫在前面從10月底開始,由克里克學(xué)院與康昱盛主辦的蛋白質(zhì)組學(xué)網(wǎng)絡(luò)大課堂正式開班了,整個(gè)課程由...