安裝Megadock在個人wsl上 整不來docker版本 官方指引https://github.com/akiyamalab/MEGADOCK/blob/master/do...
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2024-08-06_記錄MegaDock安裝使用
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基因家族的收縮與擴(kuò)張基因家族指來自諸多物種的MRCA（Most Recent Common Ancestor，最近共同祖先）的同一個始祖基因演化而來的一組基因。 研究基因家族在進(jìn)化過程中的大小變...
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基因家族擴(kuò)張收縮分析-cafe結(jié)果可視化-cafe4cafe自帶的程序，只能單獨標(biāo)注擴(kuò)增或者收縮的基因家族數(shù)。手工標(biāo)注又很麻煩，所以我寫了一個R程序，雖然圖不夠精致，不過基本解決問題。 cafe_node_filename: ...
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基因家族分析七(篩選串聯(lián)重復(fù)基因)一：篩選串聯(lián)重復(fù)基因 1.獲取NBS的CDS序列 將NBS的基因轉(zhuǎn)錄本的ID處理，一條基因只要一個CDS。EXCEL-->排序-->去重復(fù)-->合并1，2列（=A1&"."B...
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文獻(xiàn)筆記七十一：REDO根據(jù)vcf文件檢測植物細(xì)胞器基因組RNA編輯位點REDO: RNA editing detection in plant organelles based on variant calling results Journa...
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根據(jù)seqid提取fastq序列工具：seqtk 從fasta/fastq文件中提取子集 seqtk subseq head40.fq a.list 提取fq時需要其文件開頭用>: sed -i 's/@/...
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讀文章重復(fù)結(jié)果之葉綠體基因RNA editing sites prediction讀文章重復(fù)結(jié)果系列第二篇，依舊和葉綠體基因組相關(guān) RNA editing sites prediction 題目 Identification and analysis of...
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Linux 中 cut 字段提取命令
本部分主要介紹：命令 cut 的命令格式及使用方法，但其使用具有一定局限性。命令 cut 是對列進(jìn)行篩選的，而命名 grep 是對行進(jìn)行篩選的，兩者結(jié)合效果最佳。_ cut ...
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Linux 常用命令：grep-sed-awk
1.grep 查找工具 grep a 提取含有a的行g(shù)rep -n a 提取含有a的行，并標(biāo)記行號grep -v a 提取不含有a的行g(shù)rep -c a 顯示含有a的行數(shù)g...
