安裝Megadock在個(gè)人wsl上 整不來docker版本 官方指引https://github.com/akiyamalab/MEGADOCK/blob/master/do...
IP屬地：北京
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2024-08-06_記錄MegaDock安裝使用
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請(qǐng)問這個(gè)軟件出來的對(duì)接結(jié)果怎么看呀??
2024-08-06_記錄MegaDock安裝使用
安裝Megadock在個(gè)人wsl上 整不來docker版本 官方指引https://github.com/akiyamalab/MEGADOCK/blob/master/do...
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生信小白一枚，<br><br>有問題可以私信我，<br><br>謝謝。<br><br>找我合作請(qǐng)私我。
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如果是想找染色體區(qū)間內(nèi)存在的基因應(yīng)該怎么做呢
基因組位置匹配，提取gff文件信息
有一個(gè)文件weizhi，里面是三列數(shù)據(jù)，以”_“分割，第一列是染色體，第二列是開始位置，第三列是終止位置，另一個(gè)文件是H7L1_maker.gff文件，第一列是染色體，第四列...
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我也出現(xiàn)這個(gè)問題了 請(qǐng)問你解決了嗎
【比較基因組】共線性分析（JCVI）
比較基因組學(xué)中，共線性的分析的圖無疑是很漂亮的。 共線性分析可以很好地解釋進(jìn)化關(guān)系和多倍化事件。上一篇介紹了怎么利用MCScanX來做共線性分析，雖然后面有java的包來支持...
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請(qǐng)問解決了嗎？我也遇到一樣的問題
「JCVI教程」如何繪制CNS級(jí)別的共線性圖（上）
本教程借鑒https://github.com/tanghaibao/jcvi/wiki/MCscan-(Python-version). 我們先從http://plants...
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您好老師，請(qǐng)問我最后跑python -m jcvi.graphics.karyotype seqids layout命令的時(shí)候出現(xiàn)IndexError: list index out of range這個(gè)報(bào)錯(cuò)是什么原因呢
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基因家族的收縮與擴(kuò)張基因家族指來自諸多物種的MRCA（Most Recent Common Ancestor，最近共同祖先）的同一個(gè)始祖基因演化而來的一組基因。 研究基因家族在進(jìn)化過程中的大小變...
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你好，請(qǐng)問cafe5的輸出文件沒有ou t.cafe，要輸入什么文件才能怎么用CAFE_fig可視化呢
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基因家族擴(kuò)張收縮分析-cafe結(jié)果可視化-cafe4cafe自帶的程序，只能單獨(dú)標(biāo)注擴(kuò)增或者收縮的基因家族數(shù)。手工標(biāo)注又很麻煩，所以我寫了一個(gè)R程序，雖然圖不夠精致，不過基本解決問題。 cafe_node_filename: ...
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基因家族分析七(篩選串聯(lián)重復(fù)基因)一：篩選串聯(lián)重復(fù)基因 1.獲取NBS的CDS序列 將NBS的基因轉(zhuǎn)錄本的ID處理，一條基因只要一個(gè)CDS。EXCEL-->排序-->去重復(fù)-->合并1，2列（=A1&"."B...
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文獻(xiàn)筆記七十一：REDO根據(jù)vcf文件檢測(cè)植物細(xì)胞器基因組RNA編輯位點(diǎn)REDO: RNA editing detection in plant organelles based on variant calling results Journa...
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根據(jù)seqid提取fastq序列工具：seqtk 從fasta/fastq文件中提取子集 seqtk subseq head40.fq a.list 提取fq時(shí)需要其文件開頭用>: sed -i 's/@/...
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讀文章重復(fù)結(jié)果之葉綠體基因RNA editing sites prediction讀文章重復(fù)結(jié)果系列第二篇，依舊和葉綠體基因組相關(guān) RNA editing sites prediction 題目 Identification and analysis of...
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Linux 中 cut 字段提取命令
本部分主要介紹：命令 cut 的命令格式及使用方法，但其使用具有一定局限性。命令 cut 是對(duì)列進(jìn)行篩選的，而命名 grep 是對(duì)行進(jìn)行篩選的，兩者結(jié)合效果最佳。_ cut ...
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Linux 常用命令：grep-sed-awk
1.grep 查找工具 grep a 提取含有a的行g(shù)rep -n a 提取含有a的行，并標(biāo)記行號(hào)grep -v a 提取不含有a的行g(shù)rep -c a 顯示含有a的行數(shù)g...
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linux grep命令Ff和wf從兩個(gè)文件中提取相同內(nèi)容的行
首先——grep -Ff text1： text2： 輸出text2中和text1中相同的行 結(jié)果： 輸出text1中和text2中不同的行 grep -Ff只能用于兩個(gè)文件...
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從fasta文件中批量提取特定序列
如題，目的是從fasta文件中批量提取特定的基因序列.實(shí)現(xiàn)辦法有幾種： perl腳本：CSDN博主「little^raccoon」的原創(chuàng)文章perl實(shí)現(xiàn)根據(jù)序列ID從提取fa...
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2021-12-14 群體遺傳學(xué)部分概念記錄
來源： 群體遺傳進(jìn)化名詞解釋[https://www.omicsclass.com/article/1337]部分概念未經(jīng)確認(rèn)，注意甄別 1. 等位基因頻率 等位基因頻率是群...
