安裝Megadock在個(gè)人wsl上 整不來docker版本 官方指引https://github.com/akiyamalab/MEGADOCK/blob/master/do...
安裝Megadock在個(gè)人wsl上 整不來docker版本 官方指引https://github.com/akiyamalab/MEGADOCK/blob/master/do...
請(qǐng)問這個(gè)軟件出來的對(duì)接結(jié)果怎么看呀??
2024-08-06_記錄MegaDock安裝使用安裝Megadock在個(gè)人wsl上 整不來docker版本 官方指引https://github.com/akiyamalab/MEGADOCK/blob/master/do...
如果是想找染色體區(qū)間內(nèi)存在的基因應(yīng)該怎么做呢
基因組位置匹配,提取gff文件信息有一個(gè)文件weizhi,里面是三列數(shù)據(jù),以”_“分割,第一列是染色體,第二列是開始位置,第三列是終止位置,另一個(gè)文件是H7L1_maker.gff文件,第一列是染色體,第四列...
我也出現(xiàn)這個(gè)問題了 請(qǐng)問你解決了嗎
【比較基因組】共線性分析(JCVI)比較基因組學(xué)中,共線性的分析的圖無疑是很漂亮的。 共線性分析可以很好地解釋進(jìn)化關(guān)系和多倍化事件。上一篇介紹了怎么利用MCScanX來做共線性分析,雖然后面有java的包來支持...
請(qǐng)問解決了嗎?我也遇到一樣的問題
「JCVI教程」如何繪制CNS級(jí)別的共線性圖(上)本教程借鑒https://github.com/tanghaibao/jcvi/wiki/MCscan-(Python-version). 我們先從http://plants...
您好老師,請(qǐng)問我最后跑python -m jcvi.graphics.karyotype seqids layout命令的時(shí)候出現(xiàn)IndexError: list index out of range這個(gè)報(bào)錯(cuò)是什么原因呢
基因家族指來自諸多物種的MRCA(Most Recent Common Ancestor,最近共同祖先)的同一個(gè)始祖基因演化而來的一組基因。 研究基因家族在進(jìn)化過程中的大小變...
你好,請(qǐng)問cafe5的輸出文件沒有ou t.cafe,要輸入什么文件才能怎么用CAFE_fig可視化呢
cafe自帶的程序,只能單獨(dú)標(biāo)注擴(kuò)增或者收縮的基因家族數(shù)。手工標(biāo)注又很麻煩,所以我寫了一個(gè)R程序,雖然圖不夠精致,不過基本解決問題。 cafe_node_filename: ...
一:篩選串聯(lián)重復(fù)基因 1.獲取NBS的CDS序列 將NBS的基因轉(zhuǎn)錄本的ID處理,一條基因只要一個(gè)CDS。EXCEL-->排序-->去重復(fù)-->合并1,2列(=A1&"."B...
REDO: RNA editing detection in plant organelles based on variant calling results Journa...
工具:seqtk 從fasta/fastq文件中提取子集 seqtk subseq head40.fq a.list 提取fq時(shí)需要其文件開頭用>: sed -i 's/@/...
讀文章重復(fù)結(jié)果系列第二篇,依舊和葉綠體基因組相關(guān) RNA editing sites prediction 題目 Identification and analysis of...
本部分主要介紹:命令 cut 的命令格式及使用方法,但其使用具有一定局限性。命令 cut 是對(duì)列進(jìn)行篩選的,而命名 grep 是對(duì)行進(jìn)行篩選的,兩者結(jié)合效果最佳。_ cut ...
1.grep 查找工具 grep a 提取含有a的行g(shù)rep -n a 提取含有a的行,并標(biāo)記行號(hào)grep -v a 提取不含有a的行g(shù)rep -c a 顯示含有a的行數(shù)g...
首先——grep -Ff text1: text2: 輸出text2中和text1中相同的行 結(jié)果: 輸出text1中和text2中不同的行 grep -Ff只能用于兩個(gè)文件...
如題,目的是從fasta文件中批量提取特定的基因序列.實(shí)現(xiàn)辦法有幾種: perl腳本:CSDN博主「little^raccoon」的原創(chuàng)文章perl實(shí)現(xiàn)根據(jù)序列ID從提取fa...
來源: 群體遺傳進(jìn)化名詞解釋[https://www.omicsclass.com/article/1337]部分概念未經(jīng)確認(rèn),注意甄別 1. 等位基因頻率 等位基因頻率是群...