發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：上海
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基因家族擴(kuò)張收縮分析- OrthoFinder聚類基因家族1. Summary 基因家族擴(kuò)張收縮分析可細(xì)分為六部分： 獲取每個(gè)基因?qū)?yīng)的最長(zhǎng)編碼區(qū)轉(zhuǎn)錄本 OrthoFinder聚類基因家族 系統(tǒng)發(fā)育樹推...
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基因家族擴(kuò)張收縮分析-提取基因?qū)?yīng)的最長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄本
寫在前面：根據(jù)“白煙囪假說”，一切的一切都從深海熱液開始。從最初的單細(xì)胞生物到如今繁雜的世界，為了適應(yīng)不斷變化的外界環(huán)境，生物體需要不斷且緩慢地...
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基因家族擴(kuò)張收縮分析-cafe結(jié)果可視化-cafe4cafe自帶的程序，只能單獨(dú)標(biāo)注擴(kuò)增或者收縮的基因家族數(shù)。手工標(biāo)注又很麻煩，所以我寫了一個(gè)R程序，雖然圖不夠精致，不過基本解決問題。 cafe_...
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預(yù)測(cè)變異的效果基因組上有很多變異，不同變異的效果不同。除了wet-lab，現(xiàn)在也有很多軟件預(yù)測(cè)。接下來，我打算用SIFT4G、Polyphen-2、SnpEf...
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ANI隨著全基因組測(cè)序成本的不斷下降，細(xì)菌分類相關(guān)方法也從DNA-DNA hybridization（DDH）這類實(shí)驗(yàn)性方法轉(zhuǎn)移到基于基因組序列的相似...
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multiple whole genome alignment寫在前面：在上億年的進(jìn)化歷程中，基因組經(jīng)歷了大大小小的改變。從小的核苷酸突變、插入、缺失到大的基因缺失、重復(fù)、基因組重排和水平基因轉(zhuǎn)移。基因組比...
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pdf轉(zhuǎn)換1. 自己的pdf放入PPT 為了更好地展示工作，我們常常需要將pdf放入ppt。不同展示的需求不同，我們需要去掉其中的文字，重新添加。 如果直...
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tmux-os
參考鏈接：http://www.itdecent.cn/p/fd3bbdba9dc9 1. prefix 2. 配置文件 2.1. 內(nèi)容 2....
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構(gòu)建ncbi——nr本地庫網(wǎng)上方案都是用ncbi-blast+程序包的updata_blastdb.pl自動(dòng)下載，然而我下了兩天，一直斷···被逼無奈下，我只能用wget...