植物空間轉(zhuǎn)錄組分析1：Seurat基本流程 - 簡書 (jianshu.com)[http://www.itdecent.cn/p/4d8b865a8bf7] 植物空間轉(zhuǎn)錄...
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植物空間轉(zhuǎn)錄組分析1：Seurat基本流程 -
走進單細胞10X genomics了解什么是UMI，什么是barcode，再做分析之前，知道他們是在測序中引入，了解為什么引入即可。 看個簡介的視頻吧 從了解10X genomics開始陳巍學基因：http:...
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基因組文章構(gòu)成1.genome survey 數(shù)據(jù)過濾去除測序原始數(shù)據(jù)中可能包含低質(zhì)量、接頭污染以及含 N 過高的 reads NT比對通過BLAST對下機數(shù)據(jù)過濾后的有效數(shù)據(jù)進行 NT ...
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基因組共線性工具MCScanX使用說明基因組共線性工具MCScanX使用說明 簡介 MCScanX工具集對MCScan算法進行了調(diào)整，用于檢測共線性和同線性區(qū)域，還增加了可視化和下游分析。。MCscanX有三個核...
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可變剪切軟件CASH測試
可變剪切介紹： 什么是基因的可變剪切？ 有些基因的前體mRNA（pre-mRNA）通過不同的剪接方式（選擇不同的剪接位點）產(chǎn)生不同的mRNA剪接異構(gòu)體，這一過程稱為可變剪接（...
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R中實現(xiàn)基因別名的規(guī)范化【轉(zhuǎn)載】
突然間發(fā)現(xiàn)大名鼎鼎的R包limma居然有一個函數(shù)是alias2Symbol，我看了看它的描述，其功能是Convert Gene Aliases to Official Gen...
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【如何拆分多倍體亞基因組？】SubPhaser軟件SubPhaser原文鏈接：https://nph.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/nph.18173[https://nph.onl...
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應該是最新最詳細的MUMmer中文使用說明如何使用MUMmer比對大片段序列 測序技術(shù)剛開始發(fā)展的時候，大家得到的序列都是單個基因的長度，所以一般都是逐個基因的比較，用的都是BLAST或FASTA通過逐個基因聯(lián)配的方...
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【一文讀懂生物學重復與技術(shù)重復】在RNA-Seq等測序設(shè)計中，生物學重復和技術(shù)重復，是非常需要注意的問題。 那么問題就來了，生物學重復和技術(shù)重復，到底是什么？它們是如何影響我們的實驗設(shè)計的。 生物學重復（b...
