@九葉5486 從未聽說過??
輕松繪制臨床基線表Table 1Table 1是總結(jié)研究樣本中變量組成及變量間關(guān)系的一張表。R語言可以通過幾行代碼快速生成Table 1。本期用到的是“tableone”，是我制作Table 1時(shí)最喜歡用的...
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一文理清常見的基因富集分析
前言 對(duì)于很多小伙伴來說，剛?cè)胧稚艜r(shí)接觸最多的就是差異分析，即在基因組層面可以算突變率差異，轉(zhuǎn)錄組層面可以算基因表達(dá)水平差異，表觀組可以觀察甲基化水平差異，蛋白質(zhì)組/代謝組...
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R語言編程-Tidyverse 書籍 - R MarkdownR Markdown 是Markdown在R中的延伸。除了具備一般Markdown 語法功能之外，最關(guān)鍵的是可以在Rmarkdown 中插入代碼塊，并能運(yùn)行代碼，將代碼運(yùn)行結(jié)...
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R語言入門--第十二節(jié)（Logistic與泊松回歸）之前學(xué)過標(biāo)準(zhǔn)回歸分析，用預(yù)測變量預(yù)測響應(yīng)變量，響應(yīng)變量要符合正態(tài)分布。當(dāng)結(jié)果變量為二值型或者計(jì)數(shù)型可以分別用Logistic回歸，泊松回歸進(jìn)行闡釋建模；可均通過基礎(chǔ)glm()...
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設(shè)置xlim和ylim
臨床預(yù)測模型列線圖的評(píng)估：校準(zhǔn)曲線
模型構(gòu)建完成后需要對(duì)模型進(jìn)行評(píng)估和驗(yàn)證其性能。模型預(yù)測的生存率與實(shí)際的差距有多大呢？一般是看校準(zhǔn)曲線。例：一個(gè)模型（其C指數(shù)為0.8）評(píng)估某位患者5年復(fù)發(fā)率為70%。說明該模...
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生信分析闡明腫瘤純度對(duì)GC微環(huán)境的復(fù)雜作用，為個(gè)體化治療方案提供新的見解Comprehensive Characterization of Tumor Purity and Its Clinical Implications in Gastric...
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基于臨床數(shù)據(jù)構(gòu)造機(jī)器學(xué)習(xí)模型
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跟著Science學(xué)作圖：R語言ggplot2畫箭頭展示變量對(duì)主成分的貢獻(xiàn)論文 https://www.science.org/doi/10.1126/science.abk0989[https://www.science.org/doi/10.1...
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跟著Plos Biology學(xué)作圖：R語言ggplot2雙Y軸折線圖論文 Large variation in the association between seasonal antibiotic use and resistance ac...
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跟著Environmental Research學(xué)作圖：R語言ggplot2堆積柱形圖疊加折線圖（2）論文是 Global burden of lung cancer attributable to ambient fine particulate matter pollut...
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12 - SVM, KNN，LR, RF簡要介紹這里接第11篇[http://www.itdecent.cn/p/d27ba9c858ff]的介紹。 5 支持向量機(jī)（Support Vector Machine, SVM...
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文獻(xiàn)解讀09 卵巢癌轉(zhuǎn)移情況的SEER數(shù)據(jù)庫分析Deng K, Yang C, Tan Q, et al. Sites of distant metastases and overall survival in ovari...
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KNN算法-5-KNN算法總結(jié)
KNN的優(yōu)點(diǎn) 1、KNN算法是一個(gè)非常簡單的算法，理論成熟，思想簡單，既可以用來做分類也可以用來做回歸 2、天然解決多分類問題，也可用于回歸問題 3、和樸素貝葉斯之類的算法比...
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R語言拼圖（含生存分析），R語言畫布設(shè)置殺殺 發(fā)一些拼圖的小技巧 拼圖之前，先要根據(jù)自己圖片的張數(shù)，設(shè)置好畫布大小，這很重要我畫圖的經(jīng)驗(yàn)中，正常一張方形的圖會(huì)設(shè)置為width和height都等于5，如果兩張橫著拼在...
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支持向量機(jī)分類模型
開始系統(tǒng)學(xué)習(xí)一下機(jī)器學(xué)習(xí)的一些知識(shí)，這個(gè)是svm（支持向量機(jī)）分類模型。 1.R包和數(shù)據(jù) 使用了數(shù)據(jù)iris，用10%作為測試集，90％作為訓(xùn)練集。 2.模型構(gòu)建和預(yù)測 這個(gè)...
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機(jī)器學(xué)習(xí)--有監(jiān)督--支持向量機(jī)SVM支持向量機(jī)Support vector machine，SVM是一種有監(jiān)督的機(jī)器學(xué)習(xí)算法，可用于分類或者回歸。本次筆記以分類任務(wù)為例主要學(xué)習(xí)。 1、簡單理解 假設(shè)對(duì)于特征空間...
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R 數(shù)據(jù)可視化：雙坐標(biāo)系柱線圖什么是雙坐標(biāo)系柱線圖 啥么是雙坐標(biāo)系柱線圖呢？就是為了在一張圖中展示更豐富的信息，既有柱狀圖又有折線圖。如果柱狀圖和折線圖的值域不一致，比如柱狀圖表示的是數(shù)量，折線圖表示累計(jì)...
