作為表格文本處理命令awk的延伸,Heng Li開發(fā)了專門處理生物信息學(xué)的文件(例如bed, sam, vcf, gtf等)的命令bioawk,我們了解一下。 簡介 bioa...
作為表格文本處理命令awk的延伸,Heng Li開發(fā)了專門處理生物信息學(xué)的文件(例如bed, sam, vcf, gtf等)的命令bioawk,我們了解一下。 簡介 bioa...
當(dāng)我們使用的程序輸入與輸出的是多個文件,無法使用管道命令。生物信息學(xué)的程序中這種情況實際是比較常見的,假如說程序program需要2個輸入與2個輸出,那么其會產(chǎn)生4個中間結(jié)果...
寫在前面 以下內(nèi)容均來自我在菲沙基因(Frasergen[http://www.frasergen.com/])暑期生信培訓(xùn)班上記錄的課堂筆記 1.基因組組裝指標(biāo)評估 為什么...
技巧1:先禮后兵,禮貌開頭 Dear Editor and Reviewers, Thank you for your letter and for the reviewer...
0.腫瘤純度[http://222.70.95.243:6893/files/ESTIMATE%E5%88%86%E6%95%B0/estimate.html#%E8%82%...
topGO手冊中的實例實現(xiàn) 手冊地址:http://bioconductor.uib.no/2.7/bioc/vignettes/topGO/inst/doc/topGO.p...
上一篇已經(jīng)系統(tǒng)介紹了有參RNASeq上游分析,從測序數(shù)據(jù)fastq文件到最終生成表達(dá)矩陣。這一系列基本都是RNASeq通用常規(guī)分析,其下游差異表達(dá)及可視化則根據(jù)需求及...
1.創(chuàng)建本地BLAST數(shù)據(jù)庫 使用makeblastdb程序,對上述FASTA格式的蛋白 質(zhì)序列進(jìn)行處理,建立本地BLAST數(shù)據(jù)庫。makeblastdb -in ./uni...