現(xiàn)在的第三代測序技術(shù)中，主要以PacBio公司的SMRT和Oxford的Nanopore技術(shù)為主。與前面的兩代技術(shù)比較，第三代最主要的特點在于單分子測序，就是測序的過程無需進...
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三代測序技術(shù)簡介 -
@魔球魔 這些都是在linux下進行操作的。win需要你先安裝linux的虛擬機，然后再分析。
基因家族分析之orthofinder后續(xù)結(jié)果的R分析基因樹
利用orthofinder分析基因家族后，可以獲得genetree和speciestree 結(jié)果。我們可以利用R包來可視化基因樹和物種數(shù)，并對其進行簡單的編輯。 1.下載安裝...
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全基因組組裝，注釋與評估軟件集錦（更新于2020.03.20）
1.Assembly 1.1質(zhì)體基因組 1.1.1NOVOPlasty program language：Perl Reference： 10.1093/nar/gkw95...
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@嘩啦啦啦_5d8c 我暫時還沒有學(xué)會這個
6. 利用python計算蛋白序列中氨基酸出現(xiàn)的頻率
問題：假設(shè)存在一個蛋白序列seq 'MPKRKKMRLFEEDDEIRESLLGADNKDKDEDEDLQSDTENRTFLEDTDTV'，計算各個氨基酸出現(xiàn)的頻率。方法1：...
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8. python如何創(chuàng)建隨機序列
如何創(chuàng)建隨機序列 在python中的random.randint(a,b)用于生成一個指定范圍內(nèi)的整數(shù)。其中參數(shù)a是下限，參數(shù)b是上限，生成的隨機數(shù)n: a <= n <= ...
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基因家族分析八(計算串聯(lián)重復(fù)基因KAKS值)1.準備文件 即要是1，2是一對串聯(lián)重復(fù)，就將其放在一個文件內(nèi)。在上一步獲得的文件，一對重復(fù)基因是一行，所以我們就將兩列一行轉(zhuǎn)為一列兩行，并以兩行為準分割文件，最后利用生成的...
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48個實用的生信在線工具在線工具一般具有“功能強大、操作簡單、無需安裝、用完就走”的特點，輕松實現(xiàn)“用別人的服務(wù)器分析自己的數(shù)據(jù)”。 基因結(jié)構(gòu)繪制 1.Exon-Intron Graphic Mak...
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使用MAKER進行基因注釋(基礎(chǔ)入門）
在基因組注釋上，MAKER算是一個很強大的分析流程。能夠識別重復(fù)序列，將EST和蛋白序列比對到基因組，進行從頭預(yù)測，并在最后整合這三個結(jié)果保證結(jié)果的可靠性。此外，MAKER還...
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7. 利用python計算核酸序列中各堿基的次數(shù)
問題：已知一個核酸序列為seq = "AATTGC" 利用python程序計算各個堿基出現(xiàn)的頻率。 方法2： 利用count函數(shù)，統(tǒng)計ATCG四種堿基的出現(xiàn)次數(shù)。
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6. 利用python計算蛋白序列中氨基酸出現(xiàn)的頻率問題：假設(shè)存在一個蛋白序列seq 'MPKRKKMRLFEEDDEIRESLLGADNKDKDEDEDLQSDTENRTFLEDTDTV'，計算各個氨基酸出現(xiàn)的頻率。方法1：...
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4. python學(xué)習(xí)之函數(shù)學(xué)習(xí)這是python自帶的函數(shù)。 如何定義一個函數(shù)？ 練習(xí)： 設(shè)置一個重量轉(zhuǎn)換器，輸入重量為20g，輸出為kg。
