(1)是什么?含義是什么? ,全稱為fixation index,是一種用于衡量群體間分化程度的統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)量(由Wright's F-statistics衍生而來)。 一般從S...
(1)是什么?含義是什么? ,全稱為fixation index,是一種用于衡量群體間分化程度的統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)量(由Wright's F-statistics衍生而來)。 一般從S...
有沒有大蒜結(jié)種子的資源材料呀??
大基因組文章 | 大蒜 《Molecular Plant》 2020蔥屬植物是一個(gè)大的單子葉植物類別,含近千個(gè)物種,其中不少物種具有顯著的經(jīng)濟(jì)價(jià)值。大蒜是重要的蔥屬作物之一,我國大蒜的年播種面積達(dá)到1000萬畝以上。**大蒜具有膨大的鱗莖,富...
我使用FileZilla上傳RNA-seq數(shù)據(jù)。 ------------------------------------------------- 1、首先安裝FileZi...
我是一個(gè)很菜的鳥,為了計(jì)算一個(gè)基因與其他基因的相關(guān)分析,在網(wǎng)上找了很多資料!我看不懂腳本,就只能一個(gè)個(gè)死看,一個(gè)個(gè)嘗試!最后,柳暗花明,找到這個(gè)朋友推送的方法。雖然我不懂他寫...
@愛因思凱 我不會這種分析,后來也沒做了
R/qtl包的QTL學(xué)習(xí)這個(gè)包有點(diǎn)恐怖,想來我寫這個(gè)也有點(diǎn)膽戰(zhàn)心驚。http://www.rqtl.org/官網(wǎng)。 我所有的內(nèi)容的都是基于會安裝R包的基礎(chǔ),假設(shè)你已經(jīng)安裝了qtl,當(dāng)開始一項(xiàng)新的項(xiàng)目...
# 將listeria中第一表型大于250的賦值到binphe
這句話不太理解,可以詳細(xì)解釋一下嗎?
利用R/qtl1計(jì)算QTL定位,并估算其效應(yīng)值想對數(shù)量性狀表型進(jìn)行定位,首先應(yīng)該知道有多少Q(mào)TL存在,其次QTL之間是否存在互作,當(dāng) QTL數(shù)目和其互作關(guān)系確定后,就可以估算其對表型變異的解釋百分比(PVE:percen...
請問,怎么計(jì)算這幾個(gè)顯著位點(diǎn)對表型的貢獻(xiàn)率?
R/qtl包的QTL學(xué)習(xí)這個(gè)包有點(diǎn)恐怖,想來我寫這個(gè)也有點(diǎn)膽戰(zhàn)心驚。http://www.rqtl.org/官網(wǎng)。 我所有的內(nèi)容的都是基于會安裝R包的基礎(chǔ),假設(shè)你已經(jīng)安裝了qtl,當(dāng)開始一項(xiàng)新的項(xiàng)目...
論文是 Pan-genome analysis highlights the extent of genomic variation in cultivated and wi...
請問,我做RNAseq兩組數(shù)據(jù),每組20個(gè)測序樣本。如果我要分析這20個(gè)樣本是否一致,打算把離群的樣本剔除,那么我是做PCA分析還是做聚類分析? (之前看到過您發(fā)的一個(gè)關(guān)于“ 簡單解RNA-Seq”的介紹,里面講的是用PCA分析的。)謝謝!----我是生信大白
熱圖如何去掉聚類樹的同時(shí)保留聚類的順序?劉小澤寫于2020.5.15相信你看到這個(gè)問題,可能感覺很簡單,不就一個(gè)參數(shù)的問題嗎?下面來看探索(全程是基于pheatmap來做的) 首先構(gòu)建一個(gè)測試數(shù)據(jù) 然后最簡單的熱圖...
今天就當(dāng)一個(gè)小故事看吧,看了statQuest,感覺講的很棒,于是分享給大家原版視頻后臺回復(fù)“RNAseq”??花花今天效率太低寫不完推送,于是我從晚上10點(diǎn)半開始幫她,有點(diǎn)緊...
最近打算開始寫一個(gè)多組學(xué)(包括宏基因組/16S/轉(zhuǎn)錄組/蛋白組/代謝組)關(guān)聯(lián)分析的R包,避免重復(fù)造輪子,在開始之前隨便在網(wǎng)上調(diào)研了下目前已有的R包工具,部分羅列如下: 1. ...