（1）是什么？含義是什么？ ，全稱為fixation index，是一種用于衡量群體間分化程度的統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)量（由Wright's F-statistics衍生而來）。 一般從S...
IP屬地：福建
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【群體遺傳】Fst（群體間分化指數(shù)） -
有沒有大蒜結(jié)種子的資源材料呀??
大基因組文章 | 大蒜 《Molecular Plant》 2020
蔥屬植物是一個(gè)大的單子葉植物類別，含近千個(gè)物種，其中不少物種具有顯著的經(jīng)濟(jì)價(jià)值。大蒜是重要的蔥屬作物之一，我國大蒜的年播種面積達(dá)到1000萬畝以上。**大蒜具有膨大的鱗莖，富...
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2023-03-20 淺談SRA數(shù)據(jù)上傳我使用FileZilla上傳RNA-seq數(shù)據(jù)。 ------------------------------------------------- 1、首先安裝FileZi...
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基于單基因批量計(jì)算相關(guān)性分析
我是一個(gè)很菜的鳥，為了計(jì)算一個(gè)基因與其他基因的相關(guān)分析，在網(wǎng)上找了很多資料！我看不懂腳本，就只能一個(gè)個(gè)死看，一個(gè)個(gè)嘗試！最后，柳暗花明，找到這個(gè)朋友推送的方法。雖然我不懂他寫...
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@愛因思凱 我不會這種分析，后來也沒做了
R/qtl包的QTL學(xué)習(xí)
這個(gè)包有點(diǎn)恐怖，想來我寫這個(gè)也有點(diǎn)膽戰(zhàn)心驚。http://www.rqtl.org/官網(wǎng)。 我所有的內(nèi)容的都是基于會安裝R包的基礎(chǔ)，假設(shè)你已經(jīng)安裝了qtl，當(dāng)開始一項(xiàng)新的項(xiàng)目...
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# 將listeria中第一表型大于250的賦值到binphe
這句話不太理解，可以詳細(xì)解釋一下嗎？利用R/qtl1計(jì)算QTL定位，并估算其效應(yīng)值
想對數(shù)量性狀表型進(jìn)行定位，首先應(yīng)該知道有多少Q(mào)TL存在，其次QTL之間是否存在互作，當(dāng) QTL數(shù)目和其互作關(guān)系確定后，就可以估算其對表型變異的解釋百分比（PVE：percen...
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請問，怎么計(jì)算這幾個(gè)顯著位點(diǎn)對表型的貢獻(xiàn)率？
R/qtl包的QTL學(xué)習(xí)
這個(gè)包有點(diǎn)恐怖，想來我寫這個(gè)也有點(diǎn)膽戰(zhàn)心驚。http://www.rqtl.org/官網(wǎng)。 我所有的內(nèi)容的都是基于會安裝R包的基礎(chǔ)，假設(shè)你已經(jīng)安裝了qtl，當(dāng)開始一項(xiàng)新的項(xiàng)目...
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前言科學(xué)-3D2Y<br><br>簡書博客<br><a href="http://www.itdecent.cn/u/599a9e91afc8" rel="nofollow" target="_blank">http://www.itdecent.cn/u/599a9e91afc8</a><br><br>CSDN博客<br><a href="https://blog.csdn.net/leadingsci" rel="nofollow" target="_blank">https://blog.csdn.net/leadingsci</a><br><br>微店：<br><a href="https://weidian.com/?userid=583316993&wfr=wx_profile" rel="nofollow" target="_blank">https://weidian.com/?userid=583316993&wfr=wx_profile</a>
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跟著Nature Genetics學(xué)畫圖：R語言ggbio包畫基因結(jié)構(gòu)圖論文是 Pan-genome analysis highlights the extent of genomic variation in cultivated and wi...
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請問，我做RNAseq兩組數(shù)據(jù)，每組20個(gè)測序樣本。如果我要分析這20個(gè)樣本是否一致，打算把離群的樣本剔除，那么我是做PCA分析還是做聚類分析？ （之前看到過您發(fā)的一個(gè)關(guān)于“ 簡單解RNA-Seq”的介紹，里面講的是用PCA分析的。）謝謝！----我是生信大白
熱圖如何去掉聚類樹的同時(shí)保留聚類的順序？
劉小澤寫于2020.5.15相信你看到這個(gè)問題，可能感覺很簡單，不就一個(gè)參數(shù)的問題嗎？下面來看探索（全程是基于pheatmap來做的） 首先構(gòu)建一個(gè)測試數(shù)據(jù) 然后最簡單的熱圖...
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簡單理解RNA-Seq今天就當(dāng)一個(gè)小故事看吧，看了statQuest，感覺講的很棒，于是分享給大家原版視頻后臺回復(fù)“RNAseq”??花花今天效率太低寫不完推送，于是我從晚上10點(diǎn)半開始幫她，有點(diǎn)緊...
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多組學(xué)分析及可視化R包最近打算開始寫一個(gè)多組學(xué)（包括宏基因組/16S/轉(zhuǎn)錄組/蛋白組/代謝組）關(guān)聯(lián)分析的R包，避免重復(fù)造輪子，在開始之前隨便在網(wǎng)上調(diào)研了下目前已有的R包工具，部分羅列如下： 1. ...
