1.創(chuàng)建PBS腳本 #如何在linux下創(chuàng)建一個可運行shell腳本 #新建一個.sh文件 touch cellranger.count.sh #編輯test.sh文件 vi...
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Linux中如何判斷一個軟件是否安裝？
出于各種原因，要判斷實際需要的東西在哪個軟件包里，需要有點兒小技巧。 可以使用which命令來查找相關的二進制程序是否在搜索路徑中: 如果which沒有找到要找的命令，那么可...
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Monocle2包學習筆記（一）：Getting Started with Monocle
Monocle包是一個強大的單細胞轉錄組數(shù)據(jù)分析工具，它引入了一個對單細胞進行排序的新方法（擬時序分析），通過利用不同細胞轉錄調(diào)控的異步過程，將它們沿著與生物過程（如細胞分化...
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ATAC-Seq 數(shù)據(jù)分析（上）背景： 染色質(zhì)和染色體的結構和功能 每一條染色單體由單個線性DNA分子組成。細胞核中的DNA是經(jīng)過高度有序的包裝，否則就是一團亂麻，不利于DNA復制和表達調(diào)控。這種有序的狀態(tài)...
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Diffusion Map在單細胞中的應用單細胞降維 基于單細胞表達矩陣的降維方式有很多，例如UMAP，t-SNE，PCA等，而Diffusion Map是基于非線性的降維模式。對于單細胞表達譜而言，該降維方法有利于...
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實驗記錄13: scanpy細胞分化軌跡推斷大型真香現(xiàn)場
與上次翻車實驗的不同： 過濾了更多的細胞和基因。在處理數(shù)據(jù)時，低質(zhì)量的細胞一定要清除掉，告誡大家寧缺毋濫。。。否則后續(xù)分析真的是一堆的噪點。 跳過了scanpy中的降噪步驟。...
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單細胞之軌跡分析-1：RNA velocityRNA velocity原理此前已經(jīng)介紹過，參考單細胞測序的軌跡推斷[http://www.itdecent.cn/p/83c532234dc0]。 1. loom文件準備...
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GWAS學習筆記（1）-何為GWAS一、何為GWAS？ GWAS（Genome-wide Association Study）是對多個個體在全基因組范圍的遺傳變異（標記）多態(tài)性進行檢測，獲得基因型，進而將基因型...
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做生意不要帶有任何個人情緒，不要為了不是你的客戶而浪費任何時間。
在閑魚上面賣東西的一點小感悟。 因為平時的東西比較多，有的時候也會在閑魚上面轉賣一些東西，碰到了挺多各種各樣的客戶的，有一些客戶非常的爽快，而有一些客戶會一直在砍...
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流光之城 孟緒安番外 練練文筆 歡迎提建議
世真： 我鼓起了勇氣，給你寫下這封信。 我有太多的話想和你說，最該說的，是對不起。我后悔將你拉入了我的復仇計劃，你罵的沒錯，我和容定坤是一丘之貉，我自私殘暴，為了復仇而濫殺更...
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擺爛的一天，有一點后悔。
都說一日之計在于晨，這句話在我身上特別明顯的體現(xiàn)。我如果前一天熬夜了，早上起不來，那么基本第2天就毀了。 可是昨晚我怎么就控制不住我自己呢，每次11點都是要睡覺的時候，可是每...
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大學畢業(yè)半年后，天坑專業(yè)各位同學的現(xiàn)狀。
大學畢業(yè)已經(jīng)有半年了，身為一個天坑專業(yè)的學生（非生化環(huán)材，是農(nóng)業(yè)專業(yè)，懂的同學都懂）在這講述一下大學畢業(yè)后大家的生活。 其實除了少數(shù)過得好的，大部分都還沒有穩(wěn)定下來，我認為跟...
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然后老了每個孩子都推卸責任 少有的家庭是相親相愛的
農(nóng)村追求的就是多生孩子
農(nóng)村人和城市的想法是完全不一樣的，農(nóng)村人比的是多生孩子，就是最少要生兩個。 如果沒有男孩子的話，那可能一直到生到有男孩子為止。每次打電話回老家，父母總是催生孩子，哪怕是已經(jīng)有...
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這個起碼要等別人工作了再說吧。????不然你就是誘拐
結婚前的建議吧，不存在忠告。
1、盡量三十歲之前就把自己嫁了吧，不是說三十之后嫁不出去，而是選擇性比較小。如果你還沒到三十，你覺得自己男朋友窮，可以再慢慢觀察他是否有潛力，是否能夠給你婚后帶來安全感。如果...