DNA通過(guò)轉(zhuǎn)錄，控制著mRNA的合成，而mRNA是蛋白質(zhì)合成的模板，它決定了蛋白質(zhì)的序列結(jié)構(gòu)、功能等信息。把mRNA看作一種語(yǔ)言，它由4種不同堿基的核苷酸組成（A、U、C、G...
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密碼子使用偏性的分析方法介紹 -
學(xué)習(xí)密碼子偏好性的ENC-plot分析
http://www.itdecent.cn/p/acb2736bccc2?tdsourcetag=s_pcqq_aiomsg 從這個(gè)網(wǎng)頁(yè)來(lái)看，需要用R語(yǔ)言的ggplot2...
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植物葉綠體密碼子偏好RSCU聚類1.提取cds編碼序列略2.計(jì)算密碼子偏好性用EMBOSS的cusp計(jì)算 3.聚類參考（https://www.cnblogs.com/foreverycc/archive/...
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mVISTA 多序列比對(duì)葉綠體基因組mVISTA[http://genome.lbl.gov/vista/mvista/about.shtml]可對(duì)2個(gè)或者多個(gè)DNA序列進(jìn)行比較，可以對(duì)比對(duì)結(jié)果進(jìn)行可視化。 詳...
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REPuter注釋葉綠體重復(fù)序列REPuter可注釋葉綠體重復(fù)序列，包括4種類型，F(xiàn)orward（F）, Reverse (R), Complement (C), Palindromic (P)。 REPu...
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進(jìn)化樹(shù)加多序列比對(duì)結(jié)果可視化 | ggtree首先利用mega進(jìn)行多序列（clustalw）比對(duì)然后用最大似然法建樹(shù)樹(shù)文件另存為*.nwkclustalw結(jié)果另存為fas結(jié)尾的fasta格式文件 利用ggtree進(jìn)行可視...
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重測(cè)序分析（1）軟件安裝
今天開(kāi)啟重測(cè)序分析專題啦！懇請(qǐng)各位觀眾老爺點(diǎn)點(diǎn)關(guān)注！ 所有分析均在linux系統(tǒng)上完成整個(gè)重測(cè)序分析流程涉及到的軟件非常多，本節(jié)介紹重測(cè)序常用軟件的安裝方法。 安裝R包 使用...
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十一. 葉綠體基因組 SNP Calling （bwa, samtools, picard, bcftools, plink）前言 最近分析葉綠體基因組，進(jìn)行SNP Calling，網(wǎng)上搜到生信藥丸[http://www.itdecent.cn/u/068665394ccf]的簡(jiǎn)明教程 " 教程 ...
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使用Aspera上傳測(cè)序原始數(shù)據(jù)到NCBI快速上傳較大的文件 1. Aspera下載安裝 下載地址：https://downloads.asperasoft.com/connect2/[https://downloa...
