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可以分享一下可視化的方法嗎
基因家族分析 | 預(yù)測(cè)基因家族收縮與擴(kuò)張（orthofinder，cafe）
以下參照 hoptop的「基因組學(xué)」使用OrthoFinder進(jìn)行直系同源基因分析這篇帖子試跑了一遍 1.軟件安裝 2.數(shù)據(jù)準(zhǔn)備 下載「基因組學(xué)」使用OrthoFinder進(jìn)...
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老師您好，我想問(wèn)一下我運(yùn)行完orthofinder，genetree文件夾下面啥也沒(méi)有是什么情況呢
基因家族分析之orthofinder后續(xù)結(jié)果的R分析基因樹(shù)
利用orthofinder分析基因家族后，可以獲得genetree和speciestree 結(jié)果。我們可以利用R包來(lái)可視化基因樹(shù)和物種數(shù)，并對(duì)其進(jìn)行簡(jiǎn)單的編輯。 1.下載安裝...
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OrthoFinder尋找同源基因并建樹(shù)（1）一、OrthoFinder的安裝 使用之前記得查看幫助文檔: 二、OrthoFinder的使用OrthoFinder需要蛋白編碼的Fasta（fa）文件作為輸入，所以首先我們...
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怎么解決的啊
為什么orthofinder的結(jié)果沒(méi)有g(shù)ene_tree的文件？
我重新運(yùn)行了三次，但總是沒(méi)有g(shù)ene_tree的文件，我真是要哭了，怎么就是沒(méi)有結(jié)果呢？難道是數(shù)據(jù)文件沒(méi)有處理好？但是我是從ncbi下載的fasta蛋白序列，我也檢查了，沒(méi)有...
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Orthofinder 2.3Homolog是同源基因。 Orthologs,Orthologues 直系同源，是指不同物種之間的基因，起源于共同的祖先，基因功能可能一樣，但又因?yàn)檫M(jìn)化的關(guān)系，使得功能有...
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零基礎(chǔ)多物種間共線性分析首先非常感謝Cj大神開(kāi)發(fā)出來(lái)的TBtools生信工具，為生信分析做圖帶來(lái)了極大的便利。作為生信小白，在做多物種間共線性分析時(shí)，嘗試了多種方法，苦于沒(méi)有計(jì)算機(jī)基礎(chǔ)，一直沒(méi)能完成...
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SCAU課堂 | 「比較基因組分析」專用 Docker 鏡像寫在前面 沒(méi)想到，上個(gè)選修課，準(zhǔn)備示例數(shù)據(jù)和鏡像上，竟然花了我三四天....主要原因還是，「網(wǎng)速太差」。搞七搞八，終于搞定。盡管整完之后，我其實(shí)擔(dān)心學(xué)生拿到這個(gè)使用文檔也不知...
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@蒼櫻拍子_3bfe 沒(méi)有呀
7. Blast2Go
2019.12.4 https://www.blast2go.com 不知道為啥我的注冊(cè)碼激活不了，試了很久，都不行，哎。出現(xiàn)Please use the OmicsBox ...
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Pannzer2 | 推薦一款強(qiáng)大的Gene Ontology注釋網(wǎng)站很多時(shí)候，我們一直想做到出色，做到出彩，但是比我們優(yōu)秀的人，卻在相同的方向上，做了十年，出彩了十年，而且他們沒(méi)有停下腳步~~ 寫在前面 Emmm，GO注釋常常是一個(gè)有點(diǎn)爭(zhēng)議的...
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零基礎(chǔ)快速完成基因功能注釋 / GO / KEGG / PFAM...寫在前面 早前已經(jīng)推過(guò)《新手eggNOG-Mapper詳細(xì)教程》，但仍然有很多人遇到使用問(wèn)題。換句話，可能那個(gè)教程不能徹底解決大伙遇到的問(wèn)題。于是我決定寫一個(gè)完美的教程，徹底...
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7. Blast2Go2019.12.4 https://www.blast2go.com 不知道為啥我的注冊(cè)碼激活不了，試了很久，都不行，哎。出現(xiàn)Please use the OmicsBox ...
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注冊(cè)的時(shí)候提示Captcha Empty. Please retry.也沒(méi)有看到哪里也填寫，請(qǐng)問(wèn)有解決的辦法嗎
7. Blast2Go
2019.12.4 https://www.blast2go.com 不知道為啥我的注冊(cè)碼激活不了，試了很久，都不行，哎。出現(xiàn)Please use the OmicsBox ...
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Orthofinder運(yùn)行結(jié)果文件解讀OrthoFinder結(jié)果文件 運(yùn)行標(biāo)準(zhǔn)OrthoFinder會(huì)產(chǎn)生一系列文件：直系同源組、直系同源、基因樹(shù)、物種樹(shù)、基因復(fù)制事件、比較基因組學(xué)數(shù)據(jù)。結(jié)果文件在所分析物種的....
