一般還要加上保守序列建樹和全基因組建樹，才算
單拷貝直系同源基因構建物種進化樹最近用Orthofinder做物種進化樹，最后出來的物種樹的結(jié)構跟已發(fā)表研究的結(jié)果差距較大，在我的印象里Orthofinder軟件是用單拷貝直系同源基因進行建樹的，然后跟老師...
發(fā)簡信
IP屬地：江西
-
-
DUATION THESIS: 生態(tài)環(huán)境中的小可愛_枝角類_201905于獅子山-1摘要 枝角類是一種小型甲殼綱動物，是淡水浮游動物群落中的優(yōu)勢生物之一，通常被稱為“水蚤”或“紅蟲”，隸屬于節(jié)肢動物門、甲殼綱，鰓足亞綱、枝角目。在進化過程中，為了更好的保證種...
-
-
MSKCC Research Associate<br>別趕不上野心，又辜負了努力
-
-
非模式物種的一種簡單版的go，kegg富集首先推薦Kobashttp://kobas.cbi.pku.edu.cn/kobas3/genelist/[http://kobas.cbi.pku.edu.cn/kobas...
-
PyCharm激活碼前幾天pycharm激活時間過期了，想著正好可以用用Notepad++，可能是習慣了pycharm 的自動補全，自動糾錯等一系列懶人操作，用了兩天各種不習慣，今天就哆嗦著把p...
-
蛋白質(zhì)組學數(shù)據(jù)庫https://www.uniprot.org/[https://www.uniprot.org/] 1.UniProtKB 包括Swiss-Prot和TrEMBL數(shù)據(jù)庫Un...
-
DFAST-細菌基因注釋的又一選擇
之前一直用prokka來注釋細菌測序完成后得到的基因序列，一方面是后續(xù)分析所用格式大部分都是需要prokka輸出的gff，另一方面也是自己先入為主認為prokka就是注釋的唯...
-
[比較基因組] 基因家族聚類(orthovenn2)orthovenn2[https://orthovenn2.bioinfotoolkits.net/home]image.png 點擊startimage.png 選擇物種對...
-
COG database annotation
Step 1 wget -bc -r -np -nH -nd ftp://ftp.ncbi.nih.gov/pub/COG/COG2020/data/fastawget -b...
-
如何獲取KEGG Pathway上一個pathway的gene list首先導入相應的R包和數(shù)據(jù)。（上面程序里用到的幾個R包需要用biomanager來安裝。）hsa_kegg_anno即包含了KEGG數(shù)據(jù)庫中，所有與人有關的pathway的全部...
