fastqc是一款基于java的軟件，能夠?qū)y序數(shù)據(jù)的質(zhì)量進行評估。一個樣本生成一個報告，當(dāng)樣本量過多時，逐一查看樣本質(zhì)量就稍顯不方便，multiqc是一個基于Python的...
發(fā)簡信
IP屬地：河南
-
Multiqc（轉(zhuǎn)錄組分析之質(zhì)量評估）
-
TCGA文章復(fù)現(xiàn)——LncRNA-CRC預(yù)后Title:An Integrated Three-Long Non-coding RNA Signature Predicts Prognosis in Colorecta...
-
芯片數(shù)據(jù)和RNA-seq的差異分析流程由于太久沒有分析過bulk數(shù)據(jù)了，前幾天突然被要求分析一個文章的數(shù)據(jù)時有點亂了手腳，所以在這里想總結(jié)一下關(guān)于芯片數(shù)據(jù)與seq數(shù)據(jù)的差異分析流程。 假如你是小白，也剛剛了解NG...
-
TCGA數(shù)據(jù)下載和整理的三種方法TCGA數(shù)據(jù)下載方法：gdc-client，Xena和gdcRNAtools 需要下載的數(shù)據(jù)組學(xué)信息（樣本）：（存儲單個病人表達數(shù)據(jù)，需整理為表達矩陣） + （存儲樣本文件的...
-
TCGA-數(shù)據(jù)整理（counts =》表達矩陣）
0、R包安裝 1、差異表達矩陣 2、基因差異分析(三選一就可以進行后續(xù)分析) 測序的數(shù)據(jù)，DESeq2 ，edgeR一般用的比較多，接受的是RNAseq的count數(shù)據(jù)，非l...
-
找不到某些GEO數(shù)據(jù)的表達矩陣腫么辦舉個栗子，GSE99410和GSE78200。 代碼看起來沒有問題，怎么就畫不了圖？ 因為它是空數(shù)據(jù)啊。 有兩種情況 第一類，不是芯片數(shù)據(jù)，用于后續(xù)分析的文件以其他形式存儲了...
-
ICGC臨床信息（生存信息）的整理
yuxuan ICGC數(shù)據(jù)下載、表達矩陣整理相關(guān)內(nèi)容詳見小潔老師“生信星球”公眾號的推文《ICGC數(shù)據(jù)下載和整理》，本整理過程也會用其整理的數(shù)據(jù)，詳見： https://mp...
-
最全 健康減肥·變美 寶典
總結(jié)了不下5篇減肥技巧筆記得出的生活中的變美技巧 1.觀念 相信能減肥成功，就一定會瘦。 減肥是并不是一味追求瘦，而是為了更健康的生活，擁有積極的心態(tài)。 減肥就是培養(yǎng)良好生活...
-
TCGA數(shù)據(jù)庫下載：多種方法及優(yōu)缺點介紹在TCGA數(shù)據(jù)庫下載文件有很多種方法： 一.利用R語言下載（本文重點介紹這個） 方法1：TCGAbiolinks包（首推這個方法??！目前沒發(fā)現(xiàn)明顯缺點） 方法2：RTCGAT...
