寫在前面 這次分享的是遺傳所周檢民老師在2018年應(yīng)邀在《Annual Review of Plant Biology》發(fā)表的有關(guān)植物RLCK在參與植物各種生物過程的綜述"R...
寫在前面 這次分享的是遺傳所周檢民老師在2018年應(yīng)邀在《Annual Review of Plant Biology》發(fā)表的有關(guān)植物RLCK在參與植物各種生物過程的綜述"R...
Western Blot(WB),蛋白免疫印跡法,一句話,定性、定量檢測蛋白表達(dá)的一種經(jīng)典、有效的技術(shù)方法。 將電泳分離的細(xì)胞或組織蛋白轉(zhuǎn)移到PVDF膜上,用特定抗體結(jié)合蛋白...
最近有個需求,就是給定一個蛋白質(zhì)的ID號,就知道它是什么基因。比如說O49397。但有個問題是,我并不知道這是個什么東西,于是我就去搜了下。 發(fā)現(xiàn)這其實是Uniport網(wǎng)站的...
牛逼了,兄弟
R語言爬取NCBI大豆基因Locus tag數(shù)據(jù)前言 本人生信小白,爬取代碼參考R語言批量爬取NCBI基因注釋數(shù)據(jù)(以下簡稱R文)以及一份新手友好的R語言爬蟲教程,函數(shù)的解釋及說明可在R文中找到。由于R文是爬取人的基因注釋...
前言 本人生信小白,爬取代碼參考R語言批量爬取NCBI基因注釋數(shù)據(jù)(以下簡稱R文)以及一份新手友好的R語言爬蟲教程,函數(shù)的解釋及說明可在R文中找到。由于R文是爬取人的基因注釋...
系統(tǒng)發(fā)育樹是研究物種進(jìn)化歷史必不可少的信息,我們可以利用它得到一些重要歷史線索,如: 生物多樣性(物種形成或滅絕); 物種性狀進(jìn)化與多樣化(Character evoluti...
用原始表型獲得相關(guān)性系數(shù)的矩陣數(shù)據(jù)的話,則可以使用psych包的corr.test函數(shù)。導(dǎo)入數(shù)據(jù),注意不要表頭不要在里面,不然不能識別,而且不能兩列沒有一個相關(guān)的數(shù)據(jù)。 接下...
①在E2單元格輸入以下數(shù)組公式,②按Ctrl+Shift+Enter組合鍵結(jié)束,③然后向右向下填充公式 =INDEX(B,SMALL(IF(2:200=2:$200),4^8...
本腳本適用于GAPIT產(chǎn)生的GWAS結(jié)果: 匯總文件在tmp中,輸出為csv即可。提取的僅僅是顯著位點(閾值自己調(diào)整)
首先找到/etc/apt/source.list,修改成如下即可 用vim全選刪除,直接粘貼,wq保存即可、 之后 安裝好寶塔,愉快的玩耍吧
統(tǒng)計分析時候常常格式錄入時候并不是R包想要的格式,如果數(shù)據(jù)量很大,用excel轉(zhuǎn)換及其麻煩,可以考慮使用reshape2包中的melt函數(shù)進(jìn)行轉(zhuǎn)換,代碼示例如下。
現(xiàn)有區(qū)間如上,需要統(tǒng)計各區(qū)間內(nèi)的SNP個數(shù) (示例文件中的Chr文件) 公司返還的,或者說從hmp等格式上截取下來的之后SNP位點,例如下圖 由重測序或者大芯片的行數(shù)過多,無...