0.輸入數(shù)據(jù) 在生信星球公眾號聊天窗口回復(fù)exp777即可獲取，里面的數(shù)據(jù)如下： 我的小R包，從寫著玩到用起來，日漸豐滿了。今天的更新，1.5以上的版本可用哦，去我的gith...
發(fā)簡信
IP屬地：河北
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箱線圖、熱圖、火山圖、PCA、韋恩圖全部擁有 -
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寶藏R包tinyarray：常用圖表一鍵收走最近抽空整理了以前寫的函數(shù)，規(guī)范tinyarray包，反復(fù)檢查和優(yōu)化，調(diào)整了好久，終于得到下面的check結(jié)果 今天把他提交到CRAN了(是提交不是接收哈，沒有那么快)整理了...
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中山大學(xué)中山醫(yī)學(xué)院-基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)博士在讀<br>歡迎關(guān)注個(gè)人公眾號<br><br>公眾號：bioinfomics<br>博客：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fdongwei1220.github.io%2F" target="_blank">https://dongwei1220.github.io/</a><br>
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解決了，后來我用了R來整理@fc79c326f246
TCGA臨床數(shù)據(jù)的提取
TCGA臨床數(shù)據(jù)的下載這里不做介紹。下載后解壓數(shù)據(jù)會(huì)得到包含多個(gè)子文件夾的的文件，如下所示： 每個(gè)子文件夾下通常包含XML文件，有的也會(huì)包含多個(gè)文件。但我們需要用到的就是XM...
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遺傳學(xué) 博士
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生物信息學(xué)專業(yè)<br>公眾號：生信學(xué)習(xí)手冊
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R語言畫實(shí)現(xiàn)t-SNE分析和畫圖1.編一個(gè)數(shù)據(jù) 需要一個(gè)行為樣本，列為變量(例如基因)的矩陣。 2.完成tsne分析并畫圖 畫圖搞起 3.神奇參數(shù)perplexity perplexity的默認(rèn)值是30。樣...
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使用limma、Glimma和edgeR對RNA-seq數(shù)據(jù)分析筆記1 摘要 簡單且高效地分析RNA測序數(shù)據(jù)的能力正是Bioconductor的核心優(yōu)勢之一。在獲得RNA-seq基因表達(dá)矩陣后，通常需要對數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理、探索性數(shù)據(jù)分析、差異表...
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本人醫(yī)學(xué)生一枚，目前已保送至北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院讀研。<br><br>歡迎關(guān)注我的個(gè)人微信公眾號：全哥的學(xué)習(xí)生涯。里面記錄了關(guān)于自己醫(yī)學(xué)專業(yè)上的學(xué)習(xí)經(jīng)驗(yàn)，與本專業(yè)之外包括日語、英語以及數(shù)據(jù)分析中的重點(diǎn)知識匯總、學(xué)習(xí)方法與心得，當(dāng)然，還有我自己的保研歷程與經(jīng)驗(yàn)、一些生活上的感悟等等。<br><br>
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超有誠意的R語言數(shù)據(jù)讀取指南
2020-2-23 更新：import 輸入其他格式的數(shù)據(jù)報(bào)錯(cuò)的問題，可用參數(shù)format 解決，例如format = "\t"。幫助文檔中該參數(shù)解釋為： An option...
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生存分析中連續(xù)型自變量截?cái)嘀档拇_定方法題記：本文重點(diǎn)講解在生存分析中如何合理設(shè)置連續(xù)型自變量的截?cái)嘀担瑢⑦B續(xù)型自變量轉(zhuǎn)換為二分類變量。 1.背景知識 對于結(jié)果變量為二分類資料的數(shù)據(jù)，連續(xù)型自變量截?cái)嘀档拇_定一般通...
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從TCGA數(shù)據(jù)中提取lncRNA(這是一個(gè)找bug教程)從果子老師的從TCGA數(shù)據(jù)中提取lncRNA并進(jìn)行下游分析一文中，我學(xué)到了如何從TCGA表達(dá)譜數(shù)據(jù)中提取RNA。老師的教程已經(jīng)寫的很詳細(xì)了，我再補(bǔ)充一點(diǎn)：如何下載GTF注視文...
