請問您操作出來了嗎？這一塊。
使用liftover創(chuàng)建注釋Chain文件（基因組坐標轉(zhuǎn)換）問題情形： 在自己組裝出一個基因組之后，會想要看自己的序列的組裝情況和染色體朝向，或者是想根據(jù)已有的基因組注釋文件創(chuàng)建自己的基因組的注釋文件。這個時候需要的是一個chain ...
發(fā)簡信
IP屬地：陜西
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MMZZJQ ·您好，請問這一塊可以詳細操作一下嗎？
“另外，需要搭建parasol集群環(huán)境：
參考：http://genomewiki.ucsc.edu/index.php/Parasol_job_control_system
需要注意的是：文檔中并未提及需要能免密ssh localhost，需要自己手動配置免密ssh本地，設(shè)置好后其余的按照文檔要求做即可?！?/p> -
WGS分析筆記（1）—— 原始數(shù)據(jù)以及質(zhì)控更新于2020.10.27 二代測序方式分為三種：single read 單端測序paired-end read 雙端測序mate-pair read 配對測序 雖然有三種方...
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GWAS分析-說人話（22）-"最終章"
前言 “天下沒有不散的筵席”～ 正如開章所說“這個年代，誰?還有人做GWAS??？！” 也沒有想到這個系列是最受歡迎的， 親們所看到1-21章操作出來的文章，今天的狀態(tài)更新了 ...
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GWAS分析-說人話（21）-上位效應(yīng)（epistasis）分析
前言 今天說一下如何“上位”～ 1.大神橙子牛奶糖已經(jīng)寫得很清楚了，不多寫： https://www.cnblogs.com/chenwenyan/p/13813946.ht...
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GWAS分析-說人話（14）- 如何查看SNP的基因型
前言 這年頭，誰還TM的做GWAS～ 今天導(dǎo)師不是想和你看流星雨， 是想和你看看他感興趣SNPs在某個亞組數(shù)據(jù)中的基因型....... 怎么辦？ I have 一堆SNPs，...
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我是外科醫(yī)生，所以很粗暴的喲！～～<br>歡迎大家關(guān)注微博“醫(yī)學(xué)小蛋散”哦～<br>讓學(xué)醫(yī)快樂～ <br>記錄行醫(yī)之旅～
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SNP功能注釋常用數(shù)據(jù)庫1、GWAS4D 網(wǎng)址：http://mulinlab.tmu.edu.cn/gwas4d 2、SNPnexus 網(wǎng)址：https://www.snp-nexus.org/i...
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SNP位點尋找流程——傻瓜版
本人通過無數(shù)個網(wǎng)上文章的指導(dǎo)，無數(shù)個蘿卜的坑，終于摸索出了一整套完整的、傻瓜式的尋找全基因組的SNP實操流程。 僅以此文紀念我這倆個月的努力。 首先獲得序列。序列的這一塊我是...
