在使用SnapGene進(jìn)行質(zhì)粒構(gòu)建、引物設(shè)計、片段擴(kuò)增時候，你是不是也遇到如下令人頭疼的問題： 序列導(dǎo)入SnapGene后，軟件自動識別的元件Common Features有...
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如何獲取質(zhì)粒上的特征元件 -
基于pheS*負(fù)篩選標(biāo)記的細(xì)菌無痕編輯閱讀文獻(xiàn)可以拓寬學(xué)術(shù)視野，而深挖復(fù)刻文獻(xiàn)數(shù)據(jù)，有助于實(shí)驗開展的更加順利。知是行之始，行是知之成，“知行合一”，方能游刃有余。有感于此，正式開啟本人的“文獻(xiàn)掘墳”之旅！ 今天來...
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GATK Best Practices for RNA-Seq前言 GATK是由Broad institute開發(fā)的用于變異檢測(例如: SNP, Indel等)高通量測序數(shù)據(jù). 目前GATK已經(jīng)被廣泛應(yīng)用于人類以及哺乳動物從WGS (...
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測序了，然后呢（四）有了OrgDb才能進(jìn)行富集分析劉小澤寫于19.1.20-21要進(jìn)行GO或者KEGG富集分析，就需要知道每個基因?qū)?yīng)什么樣的GO/KEGG分類，OrgDb就是存儲不同數(shù)據(jù)庫基因ID之間對應(yīng)關(guān)系，以及基因與G...
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Shell三劍客 與 核酸序列寫在前面：我是想著給課題組師弟師妹們培訓(xùn)出的一些例題。哈哈哈，沒想到也難到了自己，因此花上了一些時間思考著這些平時我們用python或者其他現(xiàn)有的軟件實(shí)現(xiàn)的功能，如何用三劍客...
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2022-02-01新年愿景
2022年，將是我博士的收官之年將投稿的論文盡快發(fā)表出來，達(dá)到博士畢業(yè)的硬性條件。同步地，近期將測序文章修改完畢再投出去，做一個保底的準(zhǔn)備。年后將近期做的另外兩個miRNA功...
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電泳條帶灰度定量分析及圖形展示本文主要是解決sgRNA體外切割活性效率的評估及圖形化展示。 軟件： Gel-Pro Analyzer ImageJ 一、Gel-Pro Analyzer分析 啟動Gel-P...
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RNAi干擾真的能適用所有基因嗎？苦苦研究了那么久沒有效果，別人卻能做出似是而非的效果，而且還發(fā)表出來了。真是妙哉妙哉！ 卵巢效果這么好，統(tǒng)計的表面積都顯著降低。 但是，產(chǎn)卵統(tǒng)計竟然沒有差異，這么矛盾的實(shí)驗結(jié)...
