00 緣起 最新的R 3.5 版本特別難安裝，而且很多新的包只能在R3.5版本上工作。之前用 make source 的方式總是出錯(cuò)，R3.5的更新依賴太多，需要安裝很多依賴...
發(fā)簡信
IP屬地：河南
-
conda 安裝R語言及其R包
-
Intervene: BED文件的intersect和繪制韋恩圖一、背景介紹 通常，BED文件的overlap/intersect的操作，可以BEDtools intersect功能完成overlap和統(tǒng)計(jì)：Bedtolols inter...
-
BETA轉(zhuǎn)錄因子與表達(dá)關(guān)聯(lián)分析今天介紹和測試這款關(guān)聯(lián)ChIP-seq、RNA-seq分析軟件，BETA（Binding and Expression Target Analysis)。 該分析整合了ChI...
-
ChIP-seq之模體分析我們都知道ChIP-seq生物信息分析流程主要涉及：數(shù)據(jù)過濾、序列比對、檢峰、模體（motif）分析。其核心的問題是尋找可靠的motif，也即轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)結(jié)合的序列特征。...
-
-
ATAC轉(zhuǎn)座子序列
ATAC文庫構(gòu)建通常借助Illumina的Nextera?（Illumina）試劑盒，然而Nextera文庫涉及的序列不同于其他形式的文庫。 ATAC試驗(yàn)的模式圖 Tn5切割...
-
單細(xì)胞分析--指定細(xì)胞群的篩選
文章目的 隨著單細(xì)胞的研究越來越火熱，利用轉(zhuǎn)錄組學(xué)對單細(xì)胞進(jìn)行聚類命名的需求也越來越高，基因在不同細(xì)胞中選擇性表達(dá)造成了細(xì)胞的多樣性，因此，對細(xì)胞進(jìn)行命名關(guān)鍵點(diǎn)在于分析這些選...
-
轉(zhuǎn)|Dockerfile構(gòu)建鏡像
發(fā)現(xiàn)一篇帖子很受用，轉(zhuǎn)載至此，別無它用，侵刪。 一、關(guān)于 Dockerfile 我們知道 Docker 鏡像的生成方式有兩種，一種是基于現(xiàn)有容器進(jìn)行 commit 生成一個(gè)鏡...
-
