前言 最近在看一些關(guān)于生態(tài)、遺傳、基因組進(jìn)化等的文獻(xiàn),其中有個(gè)很多人用的也用了很久的用以判斷物種選擇壓力的數(shù)值,(Ka/Ks)。發(fā)現(xiàn)在國內(nèi)的資料中比較少,即使有,也只是教大家...
前言 最近在看一些關(guān)于生態(tài)、遺傳、基因組進(jìn)化等的文獻(xiàn),其中有個(gè)很多人用的也用了很久的用以判斷物種選擇壓力的數(shù)值,(Ka/Ks)。發(fā)現(xiàn)在國內(nèi)的資料中比較少,即使有,也只是教大家...
寫在前面 以下摘自別人簡書;因?yàn)槲覒?,或者你看:chrome-extension://cdonnmffkdaoajfknoeeecmchibpmkmg/assets/pdf/...
BWA[http://bio-bwa.sourceforge.net/]主要是將reads比對到大型基因組上,主要功能是:序列比對。首先為大型參考基因組建立索引,然后將rea...
關(guān)于基因家族鑒定及表達(dá)分析步驟,包括數(shù)據(jù)的獲取,軟件的使用,步驟流程。需要批量的重復(fù)步驟可使用腳本來完成。 1.1 此頁面下載 hmm文件 1.2 blastp 比對鑒定...
如果你想知道Linux里某個(gè)文件的分隔符都是什么,最便捷的方法就是打開文件看看啦,但有時(shí)候也會(huì)看錯(cuò),或是文件太大搜索某個(gè)分隔符耗時(shí)太長。 用程序員的方法看就是下面醬紫啦
歸納幾篇eQTL相關(guān)文章。 1.轉(zhuǎn)自https://www.cnblogs.com/Acceptyly/p/3904108.html 首先QTL是數(shù)量性狀位點(diǎn),比如身高是一個(gè)...
本文章將介紹 ①類blast軟件blast、mmseqs、diamond、hmmer的比較 ②blast、mmseqs、diamond、hmmer的使用 ③用四種軟件的實(shí)踐操...
之前畫圖用的都是師兄寫好的流程,這次需要自己畫一些簡單的圖了,中間涉及學(xué)到的一些小知識就都放這里啦,初學(xué)者,內(nèi)容不是很全。 library(ggplot2)#這個(gè)應(yīng)該都知道,...
這是我第一次寫簡書上面的文章,為什么這一次提筆想記錄一下整個(gè)下午自己遇見問題,解決問題的過程,以前都是自己解決完問題記錄在有道云筆記上就OK了,今天感覺像這樣的過程在以往的科...
一、前言 在開始寫爬蟲之前,我們先了解一下爬蟲 首先,我們需要知道爬蟲是什么,這里直接引用百度百科的定義 網(wǎng)絡(luò)爬蟲(又被稱為網(wǎng)頁蜘蛛,網(wǎng)絡(luò)機(jī)器人,在FOAF社區(qū)中間,更經(jīng)常的...
一、前言 通過前面的文章,我們已經(jīng)知道了如何獲取網(wǎng)頁和下載文件,但是前面我們獲取的網(wǎng)頁都是未經(jīng)處理的,冗余的信息太多,無法進(jìn)行分析和利用 這一節(jié)我們就來學(xué)習(xí)怎么從網(wǎng)頁中篩選自...
假設(shè)data是一個(gè)numpy.narray類型的二維數(shù)組,可以利用argsort()函數(shù)進(jìn)行行、列的排序,代碼如下:
出于各種原因,我想自己下個(gè)R,想要的版本是3.6版本的R,下載方式是通過conda下載,安裝在了自己的home目錄下,下面是具體過程,參考了:https://www.jian...
問題: 昨晚用wget下載文件的時(shí)候,不知道為什么,網(wǎng)址最后總是帶上%OD,導(dǎo)致no found。 事件過程: 1、過程截圖木有了,當(dāng)時(shí)用的wget命令如下(-c表示斷點(diǎn)傳續(xù)...
Blast Blast有好幾個(gè)工具,blastn,blastp,blastx還有tblastn,tblastx blast 是干啥的 就是你有一條query的reads,他幫...
關(guān)于snpEff:SNPeff比bcftools具有更多的注釋功能。snpeff是用于變異注釋的軟件,其中的eff是effect的意思,也就是變異的影響,雖然叫做snpeff...
目前用到的都是比較簡單的,但是因?yàn)槭窍肫饋砘蛘哒f用到了就來補(bǔ),所以比較亂...: 一、cut linux cut 命令提取指定列 - 簡書 (jianshu.com)[htt...