現(xiàn)在正是一年一度的畢業(yè)季,有人喜也有人悲。有的研究生已經(jīng)順利發(fā)表相關(guān)的論文,滿足了畢業(yè)的要求;有的研究生還在為發(fā)一篇SCI論文而發(fā)愁;有的研究生已經(jīng)選擇“躺平”,做好了延畢的...
GATK4.0 和之前的版本相比還是有較大的不同,更加趨于流程化。 軟件安裝 點(diǎn)擊此處 查看最新版本 GATK 簡(jiǎn)單說(shuō)明 GATK分析簡(jiǎn)要流程 所需數(shù)據(jù) ref.fa rea...
FASTQ with Emoji = FASTQE ?? 表情版的FASTQC,適用于Illumina 1.8+/Sanger format 使用 安裝 使用conda 或者p...
轉(zhuǎn)載的生信技能書(shū)的文章,僅用于自己學(xué)習(xí)記錄! 文章原鏈接為:http://www.bio-info-trainee.com/2775.html ;可以直接去原鏈接學(xué)習(xí)。 史上...
轉(zhuǎn)錄組還是subread快點(diǎn)
許多電腦沒(méi)有 root權(quán)限的建議使用conda安裝Trinity,效果還可以
轉(zhuǎn)錄組分析實(shí)戰(zhàn)第二節(jié):無(wú)參考基因轉(zhuǎn)錄組拼接Trinity是廣泛應(yīng)用的不依賴(lài)基因組的轉(zhuǎn)錄組分析工具 我們?cè)谶@一節(jié)中將采用Trinity在服務(wù)器端對(duì)第一節(jié)中獲得的cleandata進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組拼接 在此過(guò)程中我們會(huì)涉及軟件...
Trinity是廣泛應(yīng)用的不依賴(lài)基因組的轉(zhuǎn)錄組分析工具 我們?cè)谶@一節(jié)中將采用Trinity在服務(wù)器端對(duì)第一節(jié)中獲得的cleandata進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組拼接 在此過(guò)程中我們會(huì)涉及軟件...
本文介紹了linux下的壓縮程式tar、gzip、gunzip、bzip2、bunzip2、compress 、uncompress、 zip、 unzip、rar、unra...
Trinity是Broad Institute和Hebrew University of Jerusalem開(kāi)發(fā)的RNA-Seq數(shù)據(jù) 轉(zhuǎn)錄組組裝工具,包括三個(gè)模塊, Inch...
現(xiàn)在可以用fasterq-dump, 速度更快,請(qǐng)閱讀都8102年了,還用fastq-dump,快換fasterq-dump吧 做生信的基本上都跟NCBI-SRA打過(guò)交道,尤...