比較基因組學(xué)分析目錄 1：單拷貝基因構(gòu)建物種樹以及計(jì)算分化時(shí)間[http://www.itdecent.cn/p/10bb4410ae3d]2：基因家族收縮與擴(kuò)張分析[ht...
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比較基因組學(xué)分析3：特異節(jié)點(diǎn)基因家族富集分析（非模式物種GO/KEEG富集分析）比較基因組學(xué)分析目錄 1：單拷貝基因構(gòu)建物種樹以及計(jì)算分化時(shí)間[http://www.itdecent.cn/p/10bb4410ae3d]2：基因家族收縮與擴(kuò)張分析[ht...
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PASA（2.4.1）使用記錄
文章僅是記錄自己的學(xué)習(xí)使用，有錯(cuò)誤請(qǐng)指出，我立刻改正！ 官方說明：https://github.com/PASApipeline/PASApipeline/wiki[http...
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基于PASA進(jìn)行基因預(yù)測
PASA[http://pasa.sourceforge.net/], acronym for Program to Assemble** S**pliced Alignme...
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非模式生物重復(fù)序列注釋 RepeatModeler2+RepeatMasker4首先安裝RepeatModeler2,RepeatMasker4建議直接去官網(wǎng)下載，解壓安裝。同時(shí)安裝其他包。安裝流程這里不詳細(xì)介紹了，網(wǎng)上有很多。 假設(shè)現(xiàn)在已經(jīng)安裝完畢，并...
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基因組重復(fù)序列檢測：RepeatMasker的安裝及使用RepeatMasker是重復(fù)序列檢測的常用工具，通過與參考數(shù)據(jù)庫的相似性比對(duì)來準(zhǔn)確識(shí)別或屏蔽基因組中的重復(fù)序列，屬于同源預(yù)測注釋的方式。下文除了RepeatMasker的使...
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如何登錄web界面啊
2019-08-01 SMRTlink7.0 安裝超不順利。。。
可參考安裝流程：https://vcru.wisc.edu/simonlab/bioinformatics/programs/install/smrt.htm遇到問題1 查找...
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De novo組裝#03 | 基因組拼接（flye, wtdbg2, mecat2, canu）寫在前面 前面兩篇文章De novo組裝#01 | 測序數(shù)據(jù)質(zhì)控（fasqc+fastp）[http://www.itdecent.cn/p/7c5447517de3] ...
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如果你是程序員，或者有一顆喜歡寫程序的心，喜歡分享技術(shù)干貨、項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)、程序員日常囧事等等，歡迎投稿《程序員》專題。 專題主編：小彤花園 http://www.itdecent.cn/users/4a4eb4feee62/ 【程序員】專題拒稿指北：http://www.itdecent.cn/p/7c8b33b5f63b 投稿須知： 1.收錄相關(guān)技術(shù)文章，但不限于技術(shù)，也可以是項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)類的文章和程序員日常。 2.文章內(nèi)不得有任何推廣信息。包括但不限于公眾號(hào)、微博、微信，更不得在通過投稿后再修改文章加入推廣信息。你可以將這些推廣以及個(gè)人信息放在個(gè)人主頁介紹里。 3.字?jǐn)?shù)極少，段落混亂，大段代碼沒有放到代碼框的文章不收錄 4.不相關(guān)的內(nèi)容不收錄，請(qǐng)確認(rèn)文章內(nèi)容和本專題相關(guān) 目前針對(duì)優(yōu)質(zhì)作者及愛好者，開設(shè)了官方程序員微信群，希望加入請(qǐng)發(fā)簡信給主編小彤花園索取個(gè)人微信，主編會(huì)將你加入到【程序員】微信群，分享內(nèi)容，收獲知識(shí)。添加微信時(shí)備注昵稱。
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