IP屬地：香港
-
隨筆1當別人都拿你當回事的時候，你千萬別拿自己當回事；當別人都不拿你當回事的時候，你可一定要拿自己當回事。
-
GWAS全流程#02 | 數(shù)據(jù)準備寫在前面 gwas整套流程按順序如下： 1.測序數(shù)據(jù)質控（fastp） 2.比對&標記重復（bwa，samtools） 3.變異檢測（gatk）...
-
GWAS全流程#01 | 變異位點獲得（gatk）寫在前面 原理應用部分就不多說了，太多文章了。這里稍微注意一下樣本的選擇問題： 1.盡可能得選擇自然群體（野生個體），或者說遺傳關系相對較遠的個...
-
基因組注釋01# | 重復序列注釋（RepeatModler+RepeatMasker）寫在前面 進行這部分重復序列提取和注釋，主要是為了屏蔽基因組的重復序列，以保證后面基因結構注釋的準確性。大致的流程如下：1.首先使用Repeat...
-
R學習筆記1 | 初步認識R雖然前期陸陸續(xù)續(xù)間斷學習用過R，當時感覺自己現(xiàn)在每次用R又要花很多時間重新理解R的語言邏輯，所以想系統(tǒng)學習下R語言，主要記錄下自己的R的學習過程...
-
性染色體的鑒定（GATK4）寫在前面 性別被稱為“進化生物學問題的皇后”，一直是生命科學領域中最具吸引力和最熱門研究方向之一。而有性生物其性染色體的解析是性別研究的基礎，這...
-
De novo組裝#08 | 基因組組裝評估寫在前面 基因組組裝完成后，我們需要對我們組裝好的基因組進行一個質量評估，質量評估主要從連續(xù)性（continuity），完整性（complete...
-
De novo組裝#07 | 染色體掛載 （allhic，3d-dna）寫在前面 初始組裝經(jīng)過基因組糾錯（polish）以及去冗余（purge）之后，就可以將其掛載到染色體上，使其由contig/scaffold級別...
-
De novo組裝#06 | Scaffolding和gap filling
基于三代測序reads進行Scaffold構建以及補洞gap filling，我這里只有一種三代測序數(shù)據(jù)CLR，這里就先不做了，而且我看文章做這...