瑣碎的小筆記。歡迎討論和指正。
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謝謝老師,這樣作出免疫相關(guān)的lncRNA了(只是腫瘤樣品),但是在后續(xù)lncRNA差異分析時,沒有正常對照樣品,還是無法進(jìn)行差異分析,視頻我沒看懂,還請大神指教!謝謝1
TCGA合并GETx數(shù)據(jù)進(jìn)行免疫lncRNA提取,代碼提問問題如下: 下載TCGA腫瘤樣本,但該數(shù)據(jù)中無正常組織,合并GETx數(shù)據(jù)進(jìn)行免疫lncRNA提取,代碼部分如下: rm(list = ls()) library(limma)...
嗯嗯,就是的,剛開始學(xué)習(xí),您有更好的方法嗎?謝謝
TCGA合并GETx數(shù)據(jù)進(jìn)行免疫lncRNA提取,代碼提問問題如下: 下載TCGA腫瘤樣本,但該數(shù)據(jù)中無正常組織,合并GETx數(shù)據(jù)進(jìn)行免疫lncRNA提取,代碼部分如下: rm(list = ls()) library(limma)...
0.背景知識 TCGA或TCGA+GTEx的表達(dá)矩陣,行名都是ensamble id,因?yàn)門CGA數(shù)據(jù)的參考基因組版本是genecode V22,xena重新分析的TCGA+...
問題如下: 下載TCGA腫瘤樣本,但該數(shù)據(jù)中無正常組織,合并GETx數(shù)據(jù)進(jìn)行免疫lncRNA提取,代碼部分如下: rm(list = ls()) library(limma)...