分析流程 1.上傳四個樣本原始就文件到服務(wù)器 參考http://www.itdecent.cn/p/a84cd44bac67[http://www.itdecent.cn...
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2020-10-24 RNAseq 從fq開始分析全流程 -
lncRNA與蛋白相互作用
RIP和RNA pulldown都是研究RNA和蛋白相互作用的經(jīng)典方法，只是出發(fā)點(diǎn)不一樣而已。 RIP，RNA 結(jié)合蛋白便宜共沉淀，是從蛋白出發(fā)研究蛋白RNA相互作用的技術(shù)。...
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重組質(zhì)粒的構(gòu)建（含引物設(shè)計）本文以白細(xì)胞介素6為例，介紹基因工程重組質(zhì)粒構(gòu)建的一般步驟。 1.準(zhǔn)備 本文使用到的兩個軟件為Vector-NTI-Advance和snapgene： Vector-NTI-...
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10X單細(xì)胞（10X空間轉(zhuǎn)錄組）22種基因差異分析方法匯總hello，大家好，抓住這一周最后的小尾巴，給大家匯總一下我們單細(xì)胞數(shù)據(jù)尋找差異基因的22種方法，之前我分享的一篇文章10X單細(xì)胞（10X空間轉(zhuǎn)錄組）基因集打分方法匯總[ht...
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R實(shí)戰(zhàn) | 文章第一表:三線表的繪制[TOC] 簡介 大多數(shù)期刊文章的第一個表，即Table 1，是根據(jù)暴露程度分層的研究人群基線特征的描述性統(tǒng)計表。table1 包使得使用R生成這樣一個表非常簡單。結(jié)果輸出格...
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太好用了！批量生存分析，一步到位，還支持最佳截點(diǎn)~花花寫于2020-7-15。今天一口氣寫了幾個新的處理tcga數(shù)據(jù)的函數(shù)。加在tinyarray里了，1.3.1版本以上可用~當(dāng)前版本有一個小缺點(diǎn)，因?yàn)橛幸徊接玫搅俗址秃蛿?shù)...
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單細(xì)胞測序（scRNA-seq）通關(guān)||數(shù)據(jù)處理必知必會單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析系列教程 sc-RAN-seq 數(shù)據(jù)分析||Seurat新版教程:Guided Clustering Tutorial[https://www.jians...
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【分子分型>>免疫】01.IMMPORT+亞型+PRAD(3.25分)PMID: 雜志：Frontiers in Genetics 核心圖 知識點(diǎn) *IMMPORT[https://www.immport.org/]：由NIH資助完成的，主要針...
