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  • 我的SNP calling和核心SNP(core SNP)聚類分析流程

    個人進(jìn)行SNP分析用的軟件是snippy[https://github.com/tseemann/snippy],主要是可以一次批量完成。準(zhǔn)備工作:1.待分析的序列文件(fa...

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    conda的安裝與使用 2.0版(2022-08-12更新)

    有很多的生信軟件都可以通過conda安裝,省去了很多的安裝、修bug的煩惱。經(jīng)常是安裝到崩潰的軟件,conda一行命令就搞定了。前兩天有個胖友問我gatk 3.8的版本在哪里...

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    2020-04-27

    海底奇遇 - 小學(xué)五年級學(xué)生原創(chuàng) 蔚藍(lán)幽暗的海底,幾只小魚悠閑自在地游著,幾只螃蟹在海底的沙地上挖著洞,形狀各異的水母在快樂地嬉戲著,色彩繽紛的海藻和水草懶洋洋地伸展著...

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    R數(shù)據(jù)可視化7:氣泡圖 Bubble Plot

    “氣泡圖”這個名字聽著就很可愛是不是!今天讓我們來看看這個氣泡圖長什么樣,可以展示什么樣的數(shù)據(jù),以及如何用R作圖。 什么是氣泡圖 氣泡圖(Bubble Plot)就是由一個個...

  • 使用Windows系統(tǒng)高速下載SRA數(shù)據(jù)庫中原始數(shù)據(jù)

    官方推薦使用SRATOOLKIT,那義無反顧的就用它吧 準(zhǔn)備篇 首先:打開官網(wǎng) NCBI SRA Tool Kit下載最新的SRA版本軟件,有四種平臺軟件可選。注意自己下的版...

  • 安裝新版本samtools和bcftools(1.3.1版本)

    官方網(wǎng)站和github上的INSTALL/README有問題,要按照下面的方法安裝 git clone --branch=develop git://github.com/s...

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