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為Mac終端配置oh my zsh插件
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如果6年前讀到這本書，我至少可以省2年
8月初朋友推薦我看這本《中國人英語自學方法教程》，結果看完后，我腸子都悔青了。 這本書的封面我有印象，6年前我看到過，但卻沒買，因為那時看過一個博主的分享，這本書主要講的是用...
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你真厲害，我覺得你寫出理論來了，特別好
英語聽力和口語的理論基礎
為什么我們聽力不好。 很多人把自己聽力不好怪在不會連讀上，所以認為要學習和練習連讀，這個想法是不正確的。比如come in，連讀后聽起來是“comin”，但之所以能聽懂，并不...
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好文章，講的透徹
5分鐘讓你明白“軟鏈接”和“硬鏈接”的區(qū)別
今天在知乎上看到一篇十分有趣的問題：如何評價微軟高級工程師癡迷于soft link這一linux常見概念？ 雖然又是知名撕逼王曾某的撕逼帖，但是我還是想就題目中鏈接的問題簡單...
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用PLAM下的mcmctree做分歧時間估計
用mcmctree做分歧時間估計的時候遇到報錯： 問題是序列不符合phylip格式，每個名字沒有區(qū)分開 1.使用以下命令行將orthofinder處理好的多序列比對結果，fa...
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-x 提取CDS -y 提取pep
#GTF/GFF格式# gffread入門使用
首先了解一下GTF/GFF的格式https://asia.ensembl.org/info/website/upload/gff.html兩者的關系如下 GTF (gene ...
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樓主寫的這里：
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#根據hg19.fa提取CDS序列
gffread gencode.v19.annotation.gff3 -g hg19.fa -y tr_cds.fa
#翻譯后蛋白序列
gffread gencode.v19.annotation.gff3 -g hg19.fa -x cds.fa
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是不是寫反了？我想提CDS文件，用第一個命令，出來的tr_cds.fa是蛋白文件，
用gffread -h（help命令）看了下，是這樣寫的：
-x write a fasta file with spliced CDS for each GFF transcript（提CDS？）
-y write a protein fasta file with the translation of CDS for each record（提的CDS文件轉成pep？）
所以是不是 “-x” 和“-y” 寫反了？ -
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樓主真棒
R ggplot2 中reorder()如何降序
喜大普奔，終于解決了reorder()降序排序的問題；舉例說明一下：首先我有兩列數據：第一列是樣品名，第二列是對應數值。 先畫個簡單的barplot： 如下圖： 我想將x軸排...
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寫系列文章，山莊記，愛的主題，中醫(yī)，軍事，數理化，天文依然顯現芻形，世界各民族神話傳說，中國文學家研究系列。<br><br>打造高端知識結構，更多的是不斷地學習，以系列文為基礎，深入突破為主旨！
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生信基因功能分析工具：Orthofinder使用教程
最近Orthofinder2開始陸續(xù)更新，文章已經投發(fā)到biorkix上，在網上搜了一圈，關于Orthofinder的使用的中文教程幾乎是空白的，這周就借此機會和大家一起來學...
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文筆真流暢，通俗易懂，什么專業(yè)的呀？
地球史植物進化《三》
這是一棵樹，可這顆樹不簡單哪！生長了多少億年了。 樹中有多少種樹？多少目？每個目中有多少品種？ 讓我們將會慢慢解讀，這顆樹的樹齡有幾十億年了。 樹名叫做:植樹進化樹。 它是和...
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寫的真好
富集分析集錦
搜羅了幾篇富集分析的文章，把自己覺得特別好的在此集中展出，感謝各位作者！ 轉自劉小澤，Enrich me! 不管是轉錄組，還是芯片數據，或者其他有關基因的組學分析，每當數據分...
