情況：文件路徑有中文，文件名也包含中文。Windows系統(tǒng)。需要將“字典.xlsx”原始文件復(fù)制580個(gè)，并且進(jìn)行重命名，重命名的格式為“并且重命名為“文件X_樣本yyyy測...
IP屬地：河南
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文件批處理-建立多個(gè)副本文件并重命名-Windows
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文件批處理-在原文件名前加含數(shù)字序列的前綴-Windows
安全起見，請(qǐng)先備份文件，用復(fù)制文件做測試。 效果示例： 原文件名： 59471620240605_TES_20240605184419913.jpg……20230905 00...
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qPCR數(shù)據(jù)處理這次，我們來介紹一下qPCR的數(shù)據(jù)處理。 qPCR是什么操作 qPCR這項(xiàng)技術(shù)，被廣泛用于生物學(xué)的研究，只有有以下用途： DNA 定量 RNA 定量 Genotyping (...
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箱線圖加中位數(shù)線附linetype： 線的on/off延伸的長度：是通過包含 2 、 4、 6 或 8 個(gè)十六進(jìn)制數(shù)字的字符串完成的，這些數(shù)字給出了連續(xù)長度的長度。例如，字符串“33”指 3...
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從10xGenomics的bam文件分析pre-mRNA數(shù)據(jù)
當(dāng)只有 BAM 文件時(shí)，那么需要從下載參考基因組和注釋文件開始，然后使用這些文件進(jìn)行比對(duì)和注釋，最終通過 velocyto 分析生成 .loom 文件進(jìn)行pre-mRNA分析...
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velocyto 的輸出文件.loom 文件中主要內(nèi)容的詳細(xì)解釋
velocyto 的輸出文件通常是 .loom 格式的文件，包含了單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)中 premRNA 和 mRNA 的表達(dá)信息，以及細(xì)胞的速度估計(jì)結(jié)果。以下是 .loom 文件...
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可變剪接鑒定軟件rMATS的結(jié)果文件內(nèi)容說明是的，本篇不講解軟件的安裝使用，因?yàn)榫W(wǎng)上的教程已經(jīng)非常多了。 但是有關(guān)rMATS的輸出結(jié)果，網(wǎng)上的教程都很少提到，結(jié)果應(yīng)該怎么看？各文件各列代表了什么信息？很多老師或同學(xué)們拿...
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差異剪接分析軟件rMATS結(jié)果文件解讀(v4.1.2)第一次做差異剪接分析，rMATS做完后一頭霧水，查閱資料整理了一下結(jié)果文件。 我使用的版本是v4.1.2，用conda安裝的，軟件的安裝和使用就不細(xì)說了，網(wǎng)上已經(jīng)有很多帖子，...
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單細(xì)胞分析之細(xì)胞交互-3：CellChat常用的細(xì)胞通訊軟件：CellphoneDB[http://www.itdecent.cn/p/38a9376f5286]：是公開的人工校正的，儲(chǔ)存受體、配體以及兩種相互作用...
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細(xì)胞通訊分析【二】——CellChat分析結(jié)果可視化本期內(nèi)容同步發(fā)布于單細(xì)胞天地微信公眾號(hào)。 回顧——細(xì)胞通訊網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 前面的帖子中我們已經(jīng)成功地進(jìn)行了細(xì)胞間通訊網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建，總的來看借助下面簡易的分析流程即可完成： 今天繼續(xù)介...
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感謝??！我試了好久都沒辦法自己轉(zhuǎn)換出這個(gè)表
資料分享:KEGG通路分類表 附下載地址
KEGG通路數(shù)據(jù)庫將通路分成了7個(gè)大類，即代謝、遺傳信息處理、環(huán)境信息處理、細(xì)胞過程、有機(jī)體系統(tǒng)、人類疾病、藥物開發(fā)。見下圖： [圖片上傳中...(image-45c15f-...
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資料分享:KEGG通路分類表 附下載地址KEGG通路數(shù)據(jù)庫將通路分成了7個(gè)大類，即代謝、遺傳信息處理、環(huán)境信息處理、細(xì)胞過程、有機(jī)體系統(tǒng)、人類疾病、藥物開發(fā)。見下圖： [圖片上傳中...(image-45c15f-...
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【KEGG-1】KEGG數(shù)據(jù)庫
歡迎關(guān)注公眾號(hào)oddxix KEGG 簡介 KEGG全稱: Kyoto Encyclopedia of Genes and GenomesKEGG是一個(gè)整合了基因組、化學(xué)和系...
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# convert 1x10^ or 1.000x10^ -> 10^
l <- gsub("\\'1[\\.0]*\\'\\%\\*\\%", "", l)
注意這一句的設(shè)置哈小技巧8-坐標(biāo)軸數(shù)字改為10的N次方-ggplot2
坐標(biāo)軸的數(shù)字特別大，很多0，又不想改成log10的顯示方式時(shí)，可以改為10的N次方。 注：此方法基礎(chǔ)代碼來源于：https://groups.google.com/g/ggp...
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醫(yī)學(xué)術(shù)語中的panel到底是什么意思
1. 沒有中文翻譯的panel 翻譯醫(yī)學(xué)文件，遇到了panel這個(gè)詞。去查背景資料，簡直大吃一驚：panel這個(gè)詞竟然直接當(dāng)中文用了，如下圖： 那么問題來了，panel作為一...
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引起相變的無序結(jié)構(gòu)域（IDRs）怎么預(yù)測？跟蹤熱點(diǎn)，提升文章檔次！蛋白研究過程中，一般認(rèn)為氨基酸的序列決定了蛋白的結(jié)構(gòu)，結(jié)構(gòu)決定功能（一般指蛋白的三維結(jié)構(gòu)）。然而，近50年的研究中，有一種沒有特定三維結(jié)構(gòu)的蛋白不斷被研究人員發(fā)現(xiàn)，由于這類蛋...
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生信數(shù)據(jù)庫ID大總結(jié)&ID轉(zhuǎn)換方法
首先介紹下各個(gè)ID的轉(zhuǎn)換，比較便捷的有： 1.在線的：Uniprot ： ID mapping 工具，可以批量轉(zhuǎn)換和下載https://www.uniprot.org/id-...
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GEO數(shù)據(jù)分析中exprs提取表達(dá)矩陣，pData提取臨床信息
關(guān)于用getGEO下載數(shù)據(jù)后，會(huì)得到一個(gè)list，取出第一個(gè)列表中的元素后，再查看這第一個(gè)元素的數(shù)據(jù)類型后，發(fā)現(xiàn)他是一個(gè)對(duì)象（"ExpressionSet"），然后我們就會(huì)用...
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msigdbr 包提供多個(gè)物種的MSigDB數(shù)據(jù)
富集分析是一種大家常用分析方法；msigdb數(shù)據(jù)庫中有定義好的基因集，但其中絕大多數(shù)數(shù)據(jù)都是人類的；老鼠和其它物種的基因集有的，但是比較少，無法滿足大眾的需求。msigdbr...