Manta輸出VCF文件 Manta運(yùn)行完畢后，將在$ {MANTA_ANALYSIS_PATH}/results/variants目錄下輸出一組VCF格式的結(jié)果文件。 如果...
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一文讀懂SV檢測軟件Manta的結(jié)果文件 -
jellyfish:快速計(jì)算kmer分布
歡迎關(guān)注"生信修煉手冊"！ jellyfish可以統(tǒng)計(jì)DNA序列中Kmer的分布，它運(yùn)行速度快，內(nèi)存消耗低，支持并行，是最常用的kmer統(tǒng)計(jì)軟件之一。 官網(wǎng)如下： http:...
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生信 | 基因組組裝實(shí)戰(zhàn)（三）：Kmer評估基因組寫在前面 以下內(nèi)容均來自我在菲沙基因（Frasergen[http://www.frasergen.com/]）暑期生信培訓(xùn)班上記錄的課堂筆記 1.Kmer定義 雜合Kmer...
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生信分析16：基于PSMC估計(jì)有效群體大小本次推送是文獻(xiàn)分享16的對應(yīng)內(nèi)容。 Fig 1 有效群體大小的估計(jì)或者種群歷史動(dòng)態(tài)的估計(jì)經(jīng)常出現(xiàn)在基因組/重測序相關(guān)文章中，可視化形式一般是Fig 1。 Fig 1的解讀：由...
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中科院遺傳發(fā)育所在讀博士，研究水稻。關(guān)注植物免疫和群體遺傳進(jìn)化，經(jīng)常摸魚學(xué)生信。同名CSDN分享代碼，歡迎圍觀~
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如何下載最新的T2T-CHM13參考基因組2022年3月science發(fā)出一系列了關(guān)于這個(gè)參考基因組的文章 但是怎么下載呢 參考網(wǎng)址： 截至2022年5月，目前的版本有v2.0，v1.1，v1.0等等 因?yàn)檫@個(gè)測是一...
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中國科學(xué)院大學(xué)2021年表觀遺傳學(xué)期末思考題思考題1：表觀遺傳學(xué)概念，分子機(jī)制，及表觀遺傳經(jīng)典現(xiàn)象 一、概念： 在不改變DNA序列的前提下，所引起的可遺傳的性狀（基因表達(dá)）的變化。 二、分子機(jī)制： 1.DNA甲基化與去...
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中國科學(xué)院大學(xué)2021年表觀遺傳學(xué)期末思考題
思考題1：表觀遺傳學(xué)概念，分子機(jī)制，及表觀遺傳經(jīng)典現(xiàn)象 一、概念： 在不改變DNA序列的前提下，所引起的可遺傳的性狀（基因表達(dá)）的變化。 二、分子機(jī)制： 1.DNA甲基化與去...
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基于SPSS的時(shí)間序列分析（轉(zhuǎn)載自某大神）
應(yīng)用背景： 通過分析序列進(jìn)行合理預(yù)測，做到提前掌握未來的發(fā)展趨勢，為業(yè)務(wù)決策提供依據(jù)，這也是決策科學(xué)化的前提。 時(shí)間序列分析： 時(shí)間序列就是按時(shí)間順序排列的一組數(shù)據(jù)序列。 時(shí)...
