您好，我想咨詢您一個(gè)問題，下面代碼中輸出的結(jié)果文件.txt為什么是空白文檔?。簀uicer pre -a -o out_JBAT \
yahs.out.bin \
yahs.out_scaffolds_final.agp \
$contigsFasta.fai
# -o out_JBAT表示輸出文件名的前綴
什么年代了，還在用傳統(tǒng)的3D-DNA？之前使用的是3D-DNA流程做Hi-C的輔助組裝，它的最大優(yōu)勢(shì)就是輸出結(jié)果可以對(duì)接下游的JBAT(juicerbox with Assembly Tools)進(jìn)行手動(dòng)矯正。然...
您好，請(qǐng)問等位基因表是一個(gè)空表的問題您解決了嗎??
GMAP一款比對(duì)工具用于ALLHiC構(gòu)建等位基因表在ALLHiC使用過程中需要構(gòu)建Allele.ctg.table，用于過濾多倍體基因組中因等位序列相似引起的HiC噪音的必要輸入。官網(wǎng)提供了兩種辦法，一種是blastn，需要...
您好，請(qǐng)問這個(gè)問題您解決了嗎，我也遇到了??
De novo組裝#07 | 染色體掛載 （allhic，3d-dna）寫在前面 初始組裝經(jīng)過基因組糾錯(cuò)（polish）以及去冗余（purge）之后，就可以將其掛載到染色體上，使其由contig/scaffold級(jí)別的基因組提升到chromoso...
您好，請(qǐng)問## 用matlock將bam轉(zhuǎn)換成merged_nodups.txt文件，即juicer軟件產(chǎn)生的一種文件##這一步生成的txt文件是空的，顯示FATAL: something went wrong in process_pair，這是什么原因造成的啊??
De novo組裝#07 | 染色體掛載 （allhic，3d-dna）寫在前面 初始組裝經(jīng)過基因組糾錯(cuò)（polish）以及去冗余（purge）之后，就可以將其掛載到染色體上，使其由contig/scaffold級(jí)別的基因組提升到chromoso...
