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    【課程筆記】學(xué)CJ在騰訊課堂上的基因家族分析1

    明晰概念 基因是染色體上一段可以發(fā)生轉(zhuǎn)錄的區(qū)域 基因≠CDS 基因應(yīng)該包括:CDS 內(nèi)含子 UTR 啟動子 可轉(zhuǎn)錄的區(qū)域是多變的 我們做分析的時候常用的是蛋白序列,而蛋白序列...

  • 你好 請問行數(shù)據(jù)處理,去冗余,只保留最長轉(zhuǎn)錄本,去除可變剪切,必須使用pathon語言嗎

    基因家族擴張與收縮分析及物種進(jìn)化樹構(gòu)建(上)

    一、數(shù)據(jù)準(zhǔn)備 首先,選取不同物種的Protein數(shù)據(jù)集:Arabidopsis_thaliana.fa;Citrus_grandis.fa;Dimocarpus_longan...

  • 你好,請問原始序列直接下載,但是進(jìn)行多序列比對后不是要對其進(jìn)行剪切嗎,怎樣剪切呢?

    MEGA 構(gòu)建進(jìn)化樹步驟

    【轉(zhuǎn)載】 分子進(jìn)化的研究對象是核酸和蛋白質(zhì)序列。研究某個基因的進(jìn)化,是用它的DNA序列,還是翻譯后的蛋白質(zhì)序列呢?序列的選取要遵循以下原則:1)如果DNA序列的兩兩間的一致度...

  • MEGA 構(gòu)建進(jìn)化樹步驟

    【轉(zhuǎn)載】 分子進(jìn)化的研究對象是核酸和蛋白質(zhì)序列。研究某個基因的進(jìn)化,是用它的DNA序列,還是翻譯后的蛋白質(zhì)序列呢?序列的選取要遵循以下原則:1)如果DNA序列的兩兩間的一致度...

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