為啥我用的winLength單位是bp，最后結(jié)果也是bp。
生信分析20：基于重測序數(shù)據(jù)計算重組率在基因組上，重組率并不是均勻的。這篇大豆的文章通過高密度的芯片數(shù)據(jù)繪制了大豆全基因組的重組圖譜，結(jié)合轉(zhuǎn)錄特征以及各種表觀修飾特征，探索了重組與基因表達以及各種表觀修飾的關系。...
IP屬地：新疆
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使用gatk進行SNPCalling及下游分析（BSA等）
1 二代數(shù)據(jù)過濾（現(xiàn)在二代數(shù)據(jù)質(zhì)量較高，可不過濾） 使用fastp過濾，參數(shù)默認 fastp -w 30 -i ${i}_1.fq.gz -I ${i}_2.fq.gz -o...
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Word和WPS插入和修改目錄1 Word插入目錄 以上面格式為參考： 在Word中首先要對確定每一章標題的大綱級別 1 將光標放置在第一章的位置，右鍵段落，選擇大綱級別，改為1級，后面的小結(jié)依次改為2級...
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利用Verkko組裝基因
Verkko是一款能夠?qū)iFi和ONT數(shù)據(jù)進行混裝的工具，是一款可以用于T2T組裝的工具。 1 Verkko安裝比較簡單，利用conda可直接安裝 conda instal...
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計算多個突變體中突變基因（并集）的數(shù)目
#計算突變體中的pan基因 import sys from itertools import combinations input1 = open(sys.argv[1],'...
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測試了只用hifi數(shù)據(jù)進行組裝，感覺組裝效果不是很好
用verkko組裝基因組
背景介紹 verkko是一個最新的可以應用于二倍體基因組T2T（telomere-to-telomere）級別的基因組組裝的組裝軟件。 2022年9月14號李恒在主題為Pac...
