1.R程序并行運(yùn)算和調(diào)整R內(nèi)部允許的對(duì)象大小的限制 默認(rèn)是500 * 1024 ^ 2 = 500 Mb future在seurat的具體應(yīng)用詳見(jiàn)：https://satij...
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Seurat單細(xì)胞分析常見(jiàn)代碼-02 -
【單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組】人類T細(xì)胞亞群分析Marker基因匯總T 細(xì)胞（全部）：CD3+ Naive T cell: CD3, CD4, CCR7, CD62L+, IL-7R (CD127), THPOK Tef（效應(yīng)T細(xì)胞）： 輔助...
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10× Genomics單細(xì)胞免疫組庫(kù)VDJ分析必知必會(huì)我們生活著的世界并非只有我們自己，而是有很多小于或大于我們的生物不斷與我們交互著，有的讓我們開(kāi)心，有的使我們傷心。這就關(guān)系到一個(gè)本質(zhì)的問(wèn)題： 我是誰(shuí)？ 我是一個(gè)腦袋，一個(gè)軀體...
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常見(jiàn)實(shí)驗(yàn)室小鼠的命名規(guī)則~
中科聯(lián)盟，隨時(shí)隨地預(yù)約儀器。 根據(jù)遺傳特點(diǎn)的不同，實(shí)驗(yàn)小鼠可分為三大類： 近交系、封閉群和雜交群 。 參考標(biāo)準(zhǔn)：中國(guó)國(guó)家質(zhì)量監(jiān)督檢驗(yàn)檢疫總局發(fā)布的〖實(shí)驗(yàn)動(dòng)物 哺乳類實(shí)驗(yàn)動(dòng)物的...
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關(guān)于功能富集分析的基礎(chǔ)知識(shí)富集分析 基因富集分析（gene set enrichment analysis）是在一組基因或蛋白中找到一類過(guò)表達(dá)的基因或蛋白。研究方法可分為三種：Over-Repress...
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淺探富集分析中的超幾何分布當(dāng)我們從測(cè)序數(shù)據(jù)中得到了一系列的基因后，我們需要研究這些基因都屬于那些通路，那些通路是跟我們研究課題相關(guān)的。為了解決這一問(wèn)題，最常用的做法就是做通路注釋然后做通路富集分析，看...
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基于液滴的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序Drop-seq：從建庫(kù)到測(cè)序的介紹說(shuō)起單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組，現(xiàn)在基本已經(jīng)成為了高分文章的代名詞。由于相比于基于整塊組織或整片培養(yǎng)細(xì)胞總體RNA的bulk RNA-seq，單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的分辨率提高到了單個(gè)細(xì)胞的層面...
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10X單細(xì)胞測(cè)序分析軟件:Cell ranger單細(xì)胞測(cè)序有著漫長(zhǎng)的過(guò)去，卻只有短暫的歷史---誰(shuí)說(shuō)的！ 說(shuō)她漫長(zhǎng)是因?yàn)榈饺缃褚灿惺畮啄甑臍v史了，說(shuō)她段短暫是因?yàn)獒槍?duì)單細(xì)胞的分析工具越來(lái)越有意義開(kāi)發(fā)周期卻越來(lái)越短。一般生物...
