一、Haploview軟件的安裝依賴于java環(huán)境,因此在進(jìn)行安裝前要先安裝java。 1.官網(wǎng)下載 https://www.oracle.com/java/technolo...
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寫(xiě)在前面 半個(gè)月前,我推了一個(gè)《任何人都能掌握-基因家族分析》的騰訊課程(原本事實(shí)是開(kāi)給課題組)。在熱身課程(完全免費(fèi))中,將我個(gè)人對(duì)基因家族分析的認(rèn)知和其意義均做了說(shuō)明,感...
比較幾種主要的構(gòu)樹(shù)方法,一般情況下,若有合適的分子進(jìn)化模型可供選擇,用最大似然法(ML)構(gòu)樹(shù)獲得的結(jié)果較好;對(duì)于近緣物種序列,通常情況下使用最大簡(jiǎn)約法(MP);而對(duì)于遠(yuǎn)緣物種...
寫(xiě)在前面 最近我主要在忙兩個(gè)事情: 了結(jié)學(xué)校里相關(guān)的一些事情,也整理下手上的資料和文件 看看是否有合適的工作 寫(xiě)了一段關(guān)于找工作的感悟,不過(guò)還是刪了,哈哈。多數(shù)無(wú)益,回到主題...
今天推文的內(nèi)容重點(diǎn)是畫(huà)圖用到的輸入文件的準(zhǔn)備image.png 圖一 基因家族分析的論文中通常會(huì)把基因家族成員的進(jìn)化樹(shù)、基因結(jié)構(gòu)、motif分析放在一張圖里。效果如圖一。準(zhǔn)備...
CELLO v.2.5: subCELlular LOcalization predictor 蛋白亞細(xì)胞定位訪問(wèn)網(wǎng)址:http://cello.life.nctu.edu....
寫(xiě)在前面????最近碰到點(diǎn)需求,了解一下其他植物的病害和抗性基因,于是檢索了生物互作數(shù)據(jù)庫(kù),發(fā)現(xiàn)了Phibase和prgdb這兩個(gè)網(wǎng)站,做個(gè)簡(jiǎn)單的介紹。 1. Phibase...
寫(xiě)在前面,其中的一些具體原理包括算法以后或許會(huì)詳細(xì)添加。主要參考主源自李霞老師主編《生物信息學(xué)理論與醫(yī)學(xué)實(shí)踐》,陳銘《生物信息學(xué)》,馮世鵬《實(shí)用生物信息學(xué)》,冉隆科《生物信息...