一、Haploview軟件的安裝依賴于java環(huán)境，因此在進(jìn)行安裝前要先安裝java。 1.官網(wǎng)下載 https://www.oracle.com/java/technolo...
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Windows操作系統(tǒng)下Haploview軟件的安裝學(xué)習(xí)筆記 -
矯正基因結(jié)構(gòu)注釋 - 做有良心的基因家族分析寫(xiě)在前面 半個(gè)月前，我推了一個(gè)《任何人都能掌握-基因家族分析》的騰訊課程（原本事實(shí)是開(kāi)給課題組）。在熱身課程（完全免費(fèi)）中，將我個(gè)人對(duì)基因家族分析的認(rèn)知和其意義均做了說(shuō)明，感...
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進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建方法的選取
比較幾種主要的構(gòu)樹(shù)方法，一般情況下，若有合適的分子進(jìn)化模型可供選擇，用最大似然法（ML）構(gòu)樹(shù)獲得的結(jié)果較好；對(duì)于近緣物種序列，通常情況下使用最大簡(jiǎn)約法(MP)；而對(duì)于遠(yuǎn)緣物種...
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TBtools - 已有插件列表
寫(xiě)在前面 最近我主要在忙兩個(gè)事情： 了結(jié)學(xué)校里相關(guān)的一些事情，也整理下手上的資料和文件 看看是否有合適的工作 寫(xiě)了一段關(guān)于找工作的感悟，不過(guò)還是刪了，哈哈。多數(shù)無(wú)益，回到主題...
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使用TBtools繪制進(jìn)化樹(shù)+motif分析+基因結(jié)構(gòu)~三圖合一今天推文的內(nèi)容重點(diǎn)是畫(huà)圖用到的輸入文件的準(zhǔn)備image.png 圖一 基因家族分析的論文中通常會(huì)把基因家族成員的進(jìn)化樹(shù)、基因結(jié)構(gòu)、motif分析放在一張圖里。效果如圖一。準(zhǔn)備...
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蛋白序列亞細(xì)胞定位工具評(píng)測(cè)
CELLO v.2.5: subCELlular LOcalization predictor 蛋白亞細(xì)胞定位訪問(wèn)網(wǎng)址：http://cello.life.nctu.edu....
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【基因組學(xué)】PHI生物互作數(shù)據(jù)庫(kù)和植物R基因數(shù)據(jù)庫(kù)寫(xiě)在前面????最近碰到點(diǎn)需求，了解一下其他植物的病害和抗性基因，于是檢索了生物互作數(shù)據(jù)庫(kù)，發(fā)現(xiàn)了Phibase和prgdb這兩個(gè)網(wǎng)站，做個(gè)簡(jiǎn)單的介紹。 1. Phibase...
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核酸和蛋白質(zhì)序列比對(duì)與序列特征分析
寫(xiě)在前面，其中的一些具體原理包括算法以后或許會(huì)詳細(xì)添加。主要參考主源自李霞老師主編《生物信息學(xué)理論與醫(yī)學(xué)實(shí)踐》，陳銘《生物信息學(xué)》，馮世鵬《實(shí)用生物信息學(xué)》，冉隆科《生物信息...
