目錄介紹環(huán)境配置OrthoMCL使用統(tǒng)計(jì)聚類結(jié)果最后 介紹 OrthoMCL是一款直系同源基因聚類軟件, 它不僅能得到多個(gè)物種共有的直系同源基因, 還能夠分別獲得不同物種特有...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：湖北
-
「生信」同源基因分析——OrthoMCL -
-
Count分析基因Gain/Loss/Duplication文獻(xiàn)標(biāo)題：Count: evolutionary analysis of phylogenetic profiles with parsimony and likelihoo...
-
OrthoFinder尋找同源基因并建樹(shù)提到尋找物種之間的同源基因，大家一般想到的是OrthoMCL (http://orthomcl.org/orthomcl/） ，OrthoMCL是現(xiàn)在用的最多的一款來(lái)找直系同...
-
MrBayes構(gòu)建貝葉斯樹(shù)
1.前期準(zhǔn)備 構(gòu)建貝葉斯樹(shù)需要用到的軟件有phylosuite(序列準(zhǔn)備)、iqtree2(最適模型查找)、mrbayes(構(gòu)建貝葉斯樹(shù))。 2.phylosuite準(zhǔn)備序列...
-
R-熱圖-pheatmappheatmap是繪制熱圖的經(jīng)典R包。其中一些細(xì)節(jié)參數(shù)設(shè)置，之前每次遇到都是網(wǎng)上搜索。這次系統(tǒng)整理下常用用法，為以后繪圖提供方便。 0、示例數(shù)據(jù)與R包加載 （1）模擬示例數(shù)據(jù)...
-
群體遺傳學(xué)-選擇清除分析一、中性學(xué)說(shuō) 分子水平上，生物的演化或物種的進(jìn)化并不是自然選擇引起的，而是由中性/近中性的突變等位基因經(jīng)過(guò)遺傳漂變引起的，從而形成分子水平上的進(jìn)化性變化或種內(nèi)變異。分子演化的...
-
擴(kuò)增子分析——usearch+vsearch+qiime1
參考文章：1.http://www.itdecent.cn/p/c72bb359f050[http://www.itdecent.cn/p/c72bb359f050]2....
-
宏基因組 - (1)基因預(yù)測(cè)與基因相對(duì)豐度的計(jì)算-3.僅作筆記使用 我所用到的所有腳本可以+Q 840842906索 簡(jiǎn)單介紹一下方向也可以，說(shuō)不定以后能互相幫忙～ 注明來(lái)意，請(qǐng)實(shí)名 學(xué)校+名字 -2.兩組樣品，目的是通過(guò)...
