截至目前,無論是人的還是其他生物的,一些常見疾病還是模型都進(jìn)行過轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,而且測(cè)序數(shù)據(jù)已經(jīng)上傳至公共數(shù)據(jù)庫,如果自己的研究中恰好需要一些組學(xué)數(shù)據(jù)支持,或者課題研究需要從組學(xué)...
截至目前,無論是人的還是其他生物的,一些常見疾病還是模型都進(jìn)行過轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,而且測(cè)序數(shù)據(jù)已經(jīng)上傳至公共數(shù)據(jù)庫,如果自己的研究中恰好需要一些組學(xué)數(shù)據(jù)支持,或者課題研究需要從組學(xué)...
在twitter上看到一個(gè)圖 配色很漂亮,代碼和數(shù)據(jù)也是公開的,今天的推文來學(xué)習(xí)一下他的代碼 代碼來源的鏈接是 https://github.com/NearAndDista...
劉小澤寫于2020.2.8大概回顧一下基礎(chǔ)知識(shí) 一:ORF與CDS ORF:open reading frame(開放閱讀框) 它是理論上的蛋白編碼區(qū),一般是先在DNA序列中...
1.基因組組裝的流程 基因組組裝的大概流程如下: (1) 測(cè)序得到raw reads序列。 (2) Reads質(zhì)量評(píng)估。 (3) 原始reads質(zhì)控。 (4) 選擇合適的參數(shù)...
寫在前面 以下內(nèi)容均來自我在菲沙基因(Frasergen[http://www.frasergen.com/])暑期生信培訓(xùn)班上記錄的課堂筆記 1.基因組組裝指標(biāo)評(píng)估 為什么...
基因家族生物信息學(xué)分析 (1)基因家族分析概述 旁系同源基因 基因家族可通過基因復(fù)制進(jìn)行物種特異性擴(kuò)增,主要有染色體片段復(fù)制、串聯(lián)復(fù)制和反轉(zhuǎn)錄子轉(zhuǎn)座等三種形式,可能導(dǎo)致功能丟...
簡(jiǎn)寫 RPKM: Reads Per Kilobase of exon model per Million mapped reads (每千個(gè)堿基的轉(zhuǎn)錄每百萬映射讀取的rea...
1.核酸,基因,DNA,染色體,基因組,同源染色體,等位基因 核酸,基因,DNA,染色體 核酸:一種通常位于細(xì)胞核內(nèi)的大型生物分子,主要負(fù)責(zé)生物體遺傳信息的攜帶和傳遞。核酸有...