截至目前，無論是人的還是其他生物的，一些常見疾病還是模型都進(jìn)行過轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，而且測(cè)序數(shù)據(jù)已經(jīng)上傳至公共數(shù)據(jù)庫，如果自己的研究中恰好需要一些組學(xué)數(shù)據(jù)支持，或者課題研究需要從組學(xué)...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：新疆
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轉(zhuǎn)錄組不求人系列(二): 公共數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)挖掘
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R語言ggplot2畫漂亮的環(huán)形柱形圖的一個(gè)實(shí)例在twitter上看到一個(gè)圖 配色很漂亮，代碼和數(shù)據(jù)也是公開的，今天的推文來學(xué)習(xí)一下他的代碼 代碼來源的鏈接是 https://github.com/NearAndDista...
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生物基礎(chǔ)知識(shí)-CDS、ORF、啟動(dòng)子、終止子、轉(zhuǎn)錄因子、UTR劉小澤寫于2020.2.8大概回顧一下基礎(chǔ)知識(shí) 一：ORF與CDS ORF：open reading frame（開放閱讀框） 它是理論上的蛋白編碼區(qū)，一般是先在DNA序列中...
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基因組組裝----SOAPdenovo21.基因組組裝的流程 基因組組裝的大概流程如下： (1) 測(cè)序得到raw reads序列。 (2) Reads質(zhì)量評(píng)估。 (3) 原始reads質(zhì)控。 (4) 選擇合適的參數(shù)...
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生信 | 基因組組裝實(shí)戰(zhàn)（六）：基因組質(zhì)量、一致性、保守性、LAI等評(píng)估寫在前面 以下內(nèi)容均來自我在菲沙基因（Frasergen[http://www.frasergen.com/]）暑期生信培訓(xùn)班上記錄的課堂筆記 1.基因組組裝指標(biāo)評(píng)估 為什么...
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基因家族分析全套軟件
基因家族生物信息學(xué)分析 （1）基因家族分析概述 旁系同源基因 基因家族可通過基因復(fù)制進(jìn)行物種特異性擴(kuò)增，主要有染色體片段復(fù)制、串聯(lián)復(fù)制和反轉(zhuǎn)錄子轉(zhuǎn)座等三種形式，可能導(dǎo)致功能丟...
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RPKM、FPKM、TPM詳解
簡(jiǎn)寫 RPKM: Reads Per Kilobase of exon model per Million mapped reads (每千個(gè)堿基的轉(zhuǎn)錄每百萬映射讀取的rea...
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基礎(chǔ)知識(shí) — Exons,Introns,ORF,CDS,UTR,lncRNA,轉(zhuǎn)錄本,可變剪切,密碼子,啟動(dòng)子,順式調(diào)控元件,轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn),終止子,轉(zhuǎn)錄因子,結(jié)構(gòu)基因1.核酸，基因，DNA，染色體，基因組，同源染色體，等位基因 核酸，基因，DNA，染色體 核酸：一種通常位于細(xì)胞核內(nèi)的大型生物分子，主要負(fù)責(zé)生物體遺傳信息的攜帶和傳遞。核酸有...
