寫這個(gè)記錄的緣由,是我在生信技能樹[https://wemp.app/accounts/9b0e20f5-631b-40f3-8f16-4bdb30bc9753]上看到這樣一...
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Remove all docker related file using terminal command lines below Create .docker direct...
1、打開 https://www.ipaddress.com/[https://www.ipaddress.com/] 這個(gè)全球最好的 IP 地址查詢工具網(wǎng)站來查詢出域名當(dāng)前...
寫在前邊的話 ??在此要感謝堿基礦工[http://www.itdecent.cn/u/47e9e401869f],第一次做全外顯子測(cè)序的變異檢測(cè)時(shí)便是參考了他寫的教程,當(dāng)...
DS_Store 文件的主要作用,是存儲(chǔ)當(dāng)前文件夾在桌面顯示相關(guān)方面的一些自定義屬性,包括文件圖標(biāo)的位置、文件夾上次打開時(shí)窗口的大小、展現(xiàn)形式和位置等。 如需要阻止自動(dòng)生成,...
錯(cuò)誤提示如下: 這是因?yàn)橄到y(tǒng)沒有安裝Cairo,在終端中執(zhí)行下邊兩個(gè)命令: 然后再回到R中安裝Cairo即可成功。
WGCNA debug 運(yùn)行到這里報(bào)錯(cuò):Error in (new("standardGeneric", .Data = function (x, y = NULL, use...
個(gè)人覺得系統(tǒng)還是原裝的好,曾經(jīng)升級(jí)過幾次,但是耗電、散熱等都出現(xiàn)了異常,就又降回了原裝版本。但是每次系統(tǒng)有更新都會(huì)有一個(gè)小紅點(diǎn)提示,看著特別別扭。在系統(tǒng)設(shè)置里關(guān)閉更新設(shè)置后,...
作為一個(gè)合格的生物信息工程師,生物學(xué)的算法是必備的技能。本人從業(yè)不到一年,深感統(tǒng)計(jì)學(xué)知識(shí)匱乏,希望以簡(jiǎn)書作為自己的學(xué)習(xí)平臺(tái),和大家分享一些常用的算法,本人能力有限,只能介紹一...
轉(zhuǎn)錄組分析一般通過比對(duì)或非比對(duì)的方法對(duì)基因表達(dá)進(jìn)行定量,得到一個(gè)樣本-基因表達(dá)矩陣用于下游數(shù)據(jù)分析。下游分析通常是進(jìn)行差異表達(dá)分析,對(duì)差異基因進(jìn)行功能注視,如Gene Ont...
Step1: 首先把所有寫好的文件放在html這個(gè)文件夾中,然后上傳文件到服務(wù)器 Step2: 在服務(wù)器創(chuàng)建/var/www/html文件夾,并把上一步的文件轉(zhuǎn)移到這個(gè)文件夾...
1、Typora 這也是我現(xiàn)在主要使用的,優(yōu)點(diǎn)是界面簡(jiǎn)潔,可以即時(shí)的預(yù)覽所書寫的內(nèi)容,而且還有Windows版和Linux,無論在公司還是在家都可以使用。 缺點(diǎn)是不能同步筆記...
fastp我用挺好的啊,你是不是漏掉了--detect_adapter_for_pe這個(gè)參數(shù),如果是雙端測(cè)序,不加這個(gè)參數(shù)才會(huì)出現(xiàn)去接頭不干凈的情況,加了這個(gè)參數(shù)就沒問題了
二代測(cè)序數(shù)據(jù)(RNA-seq)比對(duì)率低怎么辦在分析二代數(shù)據(jù)的時(shí)候,很常見的一個(gè)問題就是比對(duì)率低,下面是我就經(jīng)常遇到的一些情況,以及解決方法。 影響測(cè)序數(shù)據(jù)比對(duì)率的原因 1.接頭污染: 測(cè)序接頭: 最常見的污染源就是測(cè)序...
vcf文件儲(chǔ)存的是樣本的變異信息文件,在同一批次分析中,如果不是采用joint calling的方式進(jìn)行分析,最終會(huì)獲得單個(gè)樣本的變異數(shù)據(jù)。這種文件很難對(duì)同組不同樣本進(jìn)行差異...
以GATK流程為例,簡(jiǎn)單來說,SNP Calling主要包括以下幾步: 1. 給參考基因組建立索引:samtools faidx、bwa index, gatk Create...
當(dāng)然用默認(rèn)的參數(shù)--option-file是最佳選擇,我這樣用也不是錯(cuò)呀,只是另一種傳遞參數(shù)的方式,如果prefetch沒有參數(shù)讓你傳遞整個(gè)文件,那我這種方式就很省事了,其他軟件我也有這樣用,很方便
教你3種方法下載NCBI GEO數(shù)據(jù)1.常規(guī)下載方式:prefetch ????對(duì)于常規(guī)下載sra數(shù)據(jù)來說,NCBI提供了它自己的一套工具(SRA-Toolkit),其中用prefetch來下載數(shù)據(jù),用fast...