發(fā)簡信
IP屬地：四川
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NGS數(shù)據(jù)下載
本來想重復(fù)冷泉港Lippman 2017年在Cell上的一篇文章：Bypassing Negative Epistasis on Yield i...
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3. SNP Calling以GATK流程為例，簡單來說，SNP Calling主要包括以下幾步： 1. 給參考基因組建立索引：samtools faidx、bwa ind...
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如何成為有效學(xué)習(xí)的高手
最近在得到聽了這篇文章，感覺比較有用，會隨聽隨更新。 Day 1：高效學(xué)習(xí)的定義。 高效學(xué)習(xí)，即找到最適合自己的學(xué)習(xí)手法，在相對短的時(shí)間內(nèi)集中注...
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2. BSA的原理BSA（Bulked Segregant Analysis），集群分離分析或分離群體分組分析法。兩個(gè)特點(diǎn)：1. 混池2. 性狀分離所以，BSA可...
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1. 熱身（案例及實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)）什么是BSA-seq BSA（Bulked Sergeant Analysis），即分離體分組混合分析法，也稱為集群分離分析法或混合分組分析法，...
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bash下的特殊變量及含義
特殊變量列表 $0：當(dāng)前腳本的文件名$n：傳遞給腳本或函數(shù)的參數(shù)。n 是一個(gè)數(shù)字，表示第幾個(gè)參數(shù)。例如，第一個(gè)參數(shù)是$1，第二個(gè)參數(shù)是$2。$#...
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Let's awk!
awk是Linux自帶的一種文本處理工具，能夠快速有效地對Linux下的文本文件進(jìn)行處理，尤其針對較大的文本文件。在處理生信文本文件時(shí)，相較于P...
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Lecture 11-20
本地blast使用 下載及安裝： 使用：blast與大多數(shù)序列比對軟件一樣，需要對參考序列創(chuàng)建一個(gè)哈希結(jié)構(gòu)的數(shù)據(jù)庫： 序列比對 blast可以對...
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Lecture 1-10最近這周幫助組內(nèi)成員完成一些高重復(fù)性基本濕實(shí)驗(yàn)、下地收集果實(shí)，以及自己的一小部分分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)外，花了些時(shí)間進(jìn)行了Biostar Handboo...