導(dǎo)讀 前面我們已經(jīng)整合了高質(zhì)量的細(xì)胞,現(xiàn)在我們想知道細(xì)胞群中存在的不同細(xì)胞類型 ,因此下面將進(jìn)行細(xì)胞聚類分析。 學(xué)習(xí)目標(biāo) 描述評估用于聚類的主成分?jǐn)?shù)量的方法 根據(jù)重要的主成分...
導(dǎo)讀 前面我們已經(jīng)整合了高質(zhì)量的細(xì)胞,現(xiàn)在我們想知道細(xì)胞群中存在的不同細(xì)胞類型 ,因此下面將進(jìn)行細(xì)胞聚類分析。 學(xué)習(xí)目標(biāo) 描述評估用于聚類的主成分?jǐn)?shù)量的方法 根據(jù)重要的主成分...
.rds和.rda(.Rdata的簡稱 )文件都可用于以R本機(jī)格式存儲R對象。 1. 與非本機(jī)存儲方法(例如write.table)相比,此保存方法有多個優(yōu)點(diǎn): 更緊湊,讀取...
目錄前言 計(jì)算實(shí)例 純度的計(jì)算公式2.1 結(jié)果的理解 蘭德系數(shù)(RI)的計(jì)算公式2.1 計(jì)算方法1:列舉法2.2 計(jì)算方法2:混淆矩陣2.2.1 混淆矩陣的計(jì)算(重點(diǎn))2.2...
參考: 發(fā)現(xiàn)AB區(qū)室 09 science Comprehensive mapping of long range interactions reveals folding ...
學(xué)習(xí)摸索了很久,在中文網(wǎng)沒有找到很理想的帶領(lǐng)小白入門三維基因組學(xué)的專題內(nèi)容,因此在學(xué)習(xí)的過程中想把這寫內(nèi)容記錄下來,希望對后來的像我這樣的學(xué)生能夠得到一些幫助。 隨著Hi-C...
概念 FDR,Q value,adjust p valuep-value:衡量一次檢驗(yàn)假陽性率的指標(biāo)(False positive rate) ;q value:衡量錯誤發(fā)現(xiàn)...
陳巍學(xué)基因-illumina測序原理官方-illumina測序原理步驟:一、sample prep(樣本準(zhǔn)備):基因文庫制備(一個基因組切斷再加接頭)二、cluster ge...
Shell 腳本一直以來不是很入門,很多時候就是用到再查,發(fā)現(xiàn)自己有幾個重復(fù)用比較高的點(diǎn),還是記錄一下,至少查的時候能少費(fèi)點(diǎn)功夫~~ 1. for 循環(huán) (1)列表for循環(huán)...
一、技術(shù)原理 基因組研究的維度可以分為很多種,例如下圖所示 其中Hi-C是研究三維結(jié)構(gòu)的一種方法。Hi-C技術(shù)源于染色體構(gòu)象捕獲(Chromosome Conformatio...