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2021-2-3-利用anaconda+prefetch+aspera從NCBI的SRA數(shù)據(jù)庫(kù)中下載原始測(cè)序數(shù)據(jù)記錄下下載過(guò)程，為自己和后人避坑。 1.Conda連接不上鏡像源問(wèn)題 首先是anaconda安裝軟件或創(chuàng)建環(huán)境時(shí)遇到的問(wèn)題。即使換完清華源和其他鏡像源以后依舊報(bào)錯(cuò)。 嘗試了很...
IP屬地：福建
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2021-2-3-利用anaconda+prefetch+aspera從NCBI的SRA數(shù)據(jù)庫(kù)中下載原始測(cè)序數(shù)據(jù)記錄下下載過(guò)程，為自己和后人避坑。 1.Conda連接不上鏡像源問(wèn)題 首先是anaconda安裝軟件或創(chuàng)建環(huán)境時(shí)遇到的問(wèn)題。即使換完清華源和其他鏡像源以后依舊報(bào)錯(cuò)。 嘗試了很...
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哈哈哈，沒(méi)錯(cuò)，也就看看
Perl編程練習(xí)—雙重哈希、哈希數(shù)組
前幾天晚上在練習(xí)Perl編程時(shí)突然頓悟了以前一直迷惑的哈希數(shù)組。對(duì)這一類的問(wèn)題的解決瞬間開拓了新思路。這兩天利用雙重哈希/哈希數(shù)組解決了一些數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換中的一些小問(wèn)題。記錄分享一...
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雙重哈?？粗悬c(diǎn)暈??
Perl編程練習(xí)—雙重哈希、哈希數(shù)組
前幾天晚上在練習(xí)Perl編程時(shí)突然頓悟了以前一直迷惑的哈希數(shù)組。對(duì)這一類的問(wèn)題的解決瞬間開拓了新思路。這兩天利用雙重哈希/哈希數(shù)組解決了一些數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換中的一些小問(wèn)題。記錄分享一...
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190926【R語(yǔ)言作圖】實(shí)時(shí)定量PCR(RT_PCR)① 輸入ct值，直接導(dǎo)出帶誤差線的柱狀圖。② 使用到的R包，"pcr",官方包的安裝和使用教程詳見(jiàn)：https://www.rdocumentation.org/packag...
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stringtie merge與gene_id1.不進(jìn)行merge的pipeline stringtie官方說(shuō)明文檔中說(shuō)明如果對(duì)新的異構(gòu)體不感興趣，可以使用下面簡(jiǎn)單的pipeline進(jìn)行定量，而不進(jìn)行merge 也就是說(shuō)...
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或者是bed文件里染色體編號(hào)和gff文件中染色體編號(hào)不一樣
jcvi作圖二（共線性）
一：數(shù)據(jù)準(zhǔn)備 還是用到上一步生成的ath.aly.anchors和ath.aly.anchors.new文件 1. 創(chuàng)建如下三個(gè)文件 seqids: 需要展現(xiàn)哪些序列 lay...
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北京基因組所研究生<br><br>Focus on Bioinformatics and Machine-Learning<br><br>Follow me on Github: <a href="https://github.com/Ming-Lian" rel="nofollow" target="_blank">https://github.com/Ming-Lian</a><br><br>跳出局部最優(yōu)，搜索全局最優(yōu)
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STEP4: 得到表達(dá)矩陣的流程SRA—>FASTQ—>BAM—>COUNTS 這幾個(gè)步驟而已，中間穿插一些質(zhì)控的手段，每個(gè)步驟選擇好合適的軟件即可?？梢詤⒖迹阂粋€(gè)植物轉(zhuǎn)錄組項(xiàng)目的實(shí)戰(zhàn) http://www...
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<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fwww.cnblogs.com%2Fwangprince2017%2F" target="_blank">https://www.cnblogs.com/wangprince2017/</a> 博客園<br><br><a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fblog.csdn.net%2Fu010608296" target="_blank">https://blog.csdn.net/u010608296</a> CSDN<br><br>學(xué)者網(wǎng)<a href="https://links.jianshu.com/go?to=http%3A%2F%2Fwww.scholat.com%2Fwangchuang" target="_blank">http://www.scholat.com/wangchuang</a><br><br>研究之門ReseearchGate<br><a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fwww.researchgate.net%2Fprofile%2FWang_Chuang9" target="_blank">https://www.researchgate.net/profile/Wang_Chuang9</a><br><br><br><a href="https://links.jianshu.com/go?to=http%3A%2F%2Fbbs.sciencenet.cn%2Fhome.php%3Fmod%3Dspace%26uid%3D944416%26view%3Dwc12436109" target="_blank">http://bbs.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=944416&view=wc12436109</a> 科學(xué)網(wǎng)
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48個(gè)實(shí)用的生信在線工具
在線工具一般具有“功能強(qiáng)大、操作簡(jiǎn)單、無(wú)需安裝、用完就走”的特點(diǎn)，輕松實(shí)現(xiàn)“用別人的服務(wù)器分析自己的數(shù)據(jù)”。 基因結(jié)構(gòu)繪制 1.Exon-Intron Graphic Mak...
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