enrichplot包實(shí)現(xiàn)了幾種可視化方法來幫助解釋富集結(jié)果。它支持從DOSE (Yu et al. 2015)、clusterProfiler (Yu et al. 201...
IP屬地：內(nèi)蒙古
-
enrichplot||基因富集結(jié)果可視化解決方案 -
R繪圖_ggsignif添加顯著性標(biāo)識(shí)R繪圖做生物學(xué)顯著性統(tǒng)計(jì)，然后添加顯著性標(biāo)記，但是都是手動(dòng)，比較繁瑣，好在ggplot2有個(gè)擴(kuò)展包ggsignif，提供更加人性化的方法。 參數(shù)說明：y_position： ...
-
GWAS之表型最優(yōu)無偏預(yù)測(cè)（BLUP)與遺傳力計(jì)算表型分析之最優(yōu)無偏預(yù)測(cè) 最佳線性無偏預(yù)測(cè)（Best Linear Unbiased Prediction，簡(jiǎn)稱BLUP）可以對(duì)多環(huán)境數(shù)據(jù)進(jìn)行整合，去除環(huán)境效應(yīng)，得到個(gè)體穩(wěn)定遺...
-
-
群體遺傳學(xué)習(xí)筆記-基因型缺失數(shù)據(jù)的填充
Genotype Imputation是在高通量測(cè)序中常出現(xiàn)的定義，按照義譯就是基因型填充。要真正理解imputation這個(gè)概念，我們就需要先理解基因型缺失（genotyp...
-
群體進(jìn)化-GWAS分析
群體進(jìn)化-gwas分析 群體進(jìn)化基礎(chǔ)分析 PCA 分析原理PCA(Principal Component Analysis)，即主成分分析方法，是一種使用最廣泛的數(shù)據(jù)...
-
群體遺傳學(xué)習(xí)筆記-基礎(chǔ)知識(shí)
群體遺傳學(xué)介紹 傳統(tǒng)群體遺傳學(xué)是基于觀察到的等位基因頻率與預(yù)期頻率的分析。例如，在Wright-Fisher模型下，你可能會(huì)看到有性繁殖的二倍體個(gè)體群體，而且這些種群沒有重疊...
-
mac下安裝SNPhylo遇到的坑
SNPhylo官方地址、安裝使用指南 1.在官方手冊(cè)里，要在mac 的home目錄下建一個(gè)foo文件夾 問題：終端會(huì)報(bào)錯(cuò)，沒有操作權(quán)限 解決辦法：要注釋掉auto_maste...
-
對(duì)群體遺傳學(xué)的基礎(chǔ)概念及相關(guān)分析，如系統(tǒng)發(fā)育研究，PCA（主成分分析）、群體結(jié)構(gòu)分析、親緣關(guān)系、基因流等進(jìn)行介紹，旨在搭建一個(gè)群體遺傳學(xué)研究的學(xué)習(xí)平臺(tái)。
-
Installing SNPhylo on Linux
這里不寫SNPhylo具體安裝過程，官網(wǎng)有詳細(xì)教程,主要談?dòng)龅絾栴}及解決思路。 問題是，給出R package 安裝目錄那一步，無論是給出安裝目錄（R中利用library可調(diào)...
-
@Ray錢 謝謝我已經(jīng)解決問題了。/Users/apple/Applications/Aspera\ Connect.app/Contents/Resources/ascp
在Mac 和windows上用 Aspera Connect下載NCBI Sra數(shù)據(jù)
做生信分析在NCBI上下數(shù)據(jù)是第一步，不一定非要用linux下，裝好sratools和Aspera Connect和都沒問題。在這里NCBI SRA Toolkit找屬于你版...
-
Mac下用aspera上傳重測(cè)序數(shù)據(jù)遇到的坑
關(guān)于Mac aspera的問題，困擾了幾個(gè)月。 1.沒有此目錄 解決辦法：添加環(huán)境變量 2.string not in pwd 找了很久，這樣可以解決： /Users/app...
-
請(qǐng)問一直顯示 /Users/apple/Applications/Aspera: No such file or directory是什么原因呢
在Mac 和windows上用 Aspera Connect下載NCBI Sra數(shù)據(jù)
做生信分析在NCBI上下數(shù)據(jù)是第一步，不一定非要用linux下，裝好sratools和Aspera Connect和都沒問題。在這里NCBI SRA Toolkit找屬于你版...
-
在Mac 和windows上用 Aspera Connect下載NCBI Sra數(shù)據(jù)
做生信分析在NCBI上下數(shù)據(jù)是第一步，不一定非要用linux下，裝好sratools和Aspera Connect和都沒問題。在這里NCBI SRA Toolkit找屬于你版...
-
我把過程加進(jìn)文章里
graphPad prism學(xué)習(xí)第一天
教程是基迪奧的graphPad prism入門，跟著學(xué)習(xí)了帶gap的條形圖繪制，熟悉界面和操作后，試著自己作了下分組條形圖。 帶gap的條形圖 1 創(chuàng)建new project...
-
歡迎關(guān)注微信公眾號(hào)<生信修煉手冊(cè)><br>關(guān)注公眾號(hào)，可以加入微信群，一起交流溝通
