拿到測序數(shù)據(jù)后我們首先要進(jìn)行質(zhì)量評估（Quality Control），常用的工具就是FastQC。FastQC的詳細(xì)使用說明：http://www.bioinformati...
發(fā)簡信
IP屬地：上海
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質(zhì)量檢測：FastQC -
FastQC數(shù)據(jù)質(zhì)控報(bào)告的詳細(xì)解讀
Basic Statistics 基本信息 Encoding: 測序平臺編號，現(xiàn)在Sanger/ Illumina 1.8以上都是Phred 33編碼 Total sequ...
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一文讀懂FastQC Report前言：從今天開始就開始為拼裝轉(zhuǎn)錄組做準(zhǔn)備啦，今天聽了技能樹組織的生信人論壇，感覺很有意思。特此聲明：本文所有代碼及文件經(jīng)通過本人親自實(shí)踐！絕對沒有副作用！當(dāng)然希望大家多提出寶...
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lncRNA數(shù)據(jù)處理（get fasta>>>novel lncRNA))）
情況說明：我有兩個實(shí)驗(yàn)，每個實(shí)驗(yàn)兩個重復(fù)，我現(xiàn)在要鑒定到新的lncRNA之后進(jìn)行差異分析。大體思路，我會先通過常規(guī)的鑒定novel lncRNA方法鑒定到新的轉(zhuǎn)錄本，將轉(zhuǎn)錄本...
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手把手入門--DESeq2差異基因分析準(zhǔn)備工作 需要你先安裝好R-3.6.0 、Rtools-3.5、Rstudio，這是基本的運(yùn)行環(huán)境。 然后再此基礎(chǔ)上安裝DESeq2 的R包。 >Install.packag...
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Primer Premier 5.0引物設(shè)計(jì)PCR引物設(shè)計(jì)⑴ 確定PCR產(chǎn)物片段大?。╬roduct length）；⑵ 確定引物所在區(qū)段；⑶ 確定引物序列的長度范圍（primer length ）；⑷ 確定引物Tm值...
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生信＋實(shí)驗(yàn)：最全單基因研究套路總結(jié)
隨著測序技術(shù)的發(fā)展，每年測序數(shù)據(jù)量以PB級增長。隨著海量測序數(shù)據(jù)的增長，越來越多的研究人員開始挖掘公共數(shù)據(jù)庫中的測序數(shù)據(jù)的意義。已有很多研究表明，某個基因可能參與了某種腫瘤的...
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高通量測序中的接頭（adapter）到底是什么主要參考 祝讓飛 的文章及 Tufts 網(wǎng)站中的信息，特此致謝。 首先放一張測序示意圖，在DNA片段兩端所加的序列即接頭序列，也就是我們今天要講述的主角。 1 基本概念 1....
