一、在線工具 在線地址：https://www.md5ma.com/md5-calculator 二、Windows11查看文件的MD5值 在 windows 的命令行窗口，...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：上海
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比對(duì)軟件（DNA or RNA序列）的區(qū)別
文章僅是記錄自己的學(xué)習(xí)使用，有錯(cuò)誤請(qǐng)指出，我立刻改正！ 更多說(shuō)明：https://zhuanlan.zhihu.com/p/451939113[https://zhuanla...
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測(cè)序中的Y型接頭
一直說(shuō)比對(duì)之前要去接頭，那么我們?nèi)サ慕宇^是什么樣子的呢？我一開始以為就是在待測(cè)序的reads加上一段堿基順序已知的序列就可以了，后來(lái)發(fā)現(xiàn) 情況和我想象的不大一樣。怎么回事捏？...
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deeptools工具系列——比較不同bw_bam的信號(hào)差異目錄 前言 bamCompare 工具1.1 工具原理1.2 使用說(shuō)明1.3 使用實(shí)例 bigwigCompare 工具2.1 使用說(shuō)明2.2 使用實(shí)例 前言 今天主要介紹下...
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ChIPseeker 餅圖圖層覆蓋問(wèn)題參考： 「r<-包|ggplot2|grid」ggplotify——連接各類R圖形R神包export的使用 緣由; 最近使用ChIPseeker 對(duì)peak進(jìn)行了注釋，畫一個(gè)...
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關(guān)于Hisat2的參考基因組和注釋文件
已知Gencode的注釋文件（gtf和gff3）都是帶“chr”’的，UCSC帶“chr”，ENSEMBL不帶“chr”，NCBI最新的甚至不帶染色體號(hào)（建議摒棄NCBI的，...
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基礎(chǔ)——illumina測(cè)序原理與細(xì)節(jié)（以RNA-seq為例）目前我們主要分析的數(shù)據(jù)還是二代測(cè)序的數(shù)據(jù)，也就是大家經(jīng)常掛在嘴邊的 NGS，而這其中最大的贏家應(yīng)該算是 illumina 測(cè)序公司了，其經(jīng)典的邊合成邊測(cè)序（sequencin...
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基因注釋
前情提要 搞NGS，注釋文件是我們經(jīng)常需要用到的。但是不同的實(shí)驗(yàn)室偏愛的數(shù)據(jù)庫(kù)各不相同，甚至同一個(gè)課題組的小伙伴都會(huì)選擇不同來(lái)源的數(shù)據(jù)庫(kù)。那么不同來(lái)源的數(shù)據(jù)庫(kù)是否有什么不同呢...
