前言 最近一直在看小麥表觀遺傳相關(guān)的文獻(xiàn)，然后下載了文章中的數(shù)據(jù)進(jìn)行分析，分析的流程大致跟網(wǎng)上教程相似，但是由于小麥基因組比較大（16G），研究不像人類，小鼠及一些模式植物廣...
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小麥ChIP-seq初步分析 -
小麥ChIP-seq初步分析
前言 最近一直在看小麥表觀遺傳相關(guān)的文獻(xiàn)，然后下載了文章中的數(shù)據(jù)進(jìn)行分析，分析的流程大致跟網(wǎng)上教程相似，但是由于小麥基因組比較大（16G），研究不像人類，小鼠及一些模式植物廣...
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2021-07-08 Ka&Ks 【修正版】Ka/Ks比值：核酸分子進(jìn)化的指標(biāo)（初級篇）搬運工一枚，只為記錄學(xué)習(xí)，原文出自https://www.sohu.com/a/204503028_761120，侵權(quán)即刪 這篇文章之前推送過，但出現(xiàn)幾點瑕疵，應(yīng)廣大粉絲留言...
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基因組重復(fù)序列檢測：RepeatMasker的安裝及使用RepeatMasker是重復(fù)序列檢測的常用工具，通過與參考數(shù)據(jù)庫的相似性比對來準(zhǔn)確識別或屏蔽基因組中的重復(fù)序列，屬于同源預(yù)測注釋的方式。下文除了RepeatMasker的使...
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基因組重復(fù)序列檢測：RepeatMasker的安裝及使用
RepeatMasker是重復(fù)序列檢測的常用工具，通過與參考數(shù)據(jù)庫的相似性比對來準(zhǔn)確識別或屏蔽基因組中的重復(fù)序列，屬于同源預(yù)測注釋的方式。下文除了RepeatMasker的使...
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已解決 | 在conda環(huán)境中無法找到GLIBCXX_3.4.21
有時候conda莫名奇妙就會丟失一些庫，幾周前運行得好好的環(huán)境，卻在前天import torch的時候突然提示： 看提示發(fā)現(xiàn)，這是個conda環(huán)境，卻調(diào)用了系統(tǒng)庫。我確信我在...
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JIGplot開發(fā) - 笛卡爾坐標(biāo)系 - 坐標(biāo)軸轉(zhuǎn)換寫在前面 進(jìn)行轉(zhuǎn)換 原始圖片 X軸-翻轉(zhuǎn) X軸-翻轉(zhuǎn)，Y軸-翻轉(zhuǎn) X軸與Y軸調(diào)換 X軸與Y軸調(diào)換 Y軸翻轉(zhuǎn) X軸與Y軸調(diào)換 X軸翻轉(zhuǎn) X軸與Y軸調(diào)換 X軸-翻轉(zhuǎn) Y軸-翻轉(zhuǎn)
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植物啟動子-順式作用元件-批量提取-預(yù)測-可視化分析寫在前面 以前總看到問題是，基因結(jié)構(gòu)可視化的問題；現(xiàn)在則變成了啟動子元件的預(yù)測或者說可視化。這本身比較簡單，也比較玄乎，所以我一直不是太樂意與別人討論。但學(xué)院今天斷網(wǎng)，手上的...
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熱圖聚類位置不如意？你動手調(diào)啊...寫在前面 正如上圖，左右其實都是一組數(shù)據(jù)出來的圖片，基因之間的聚類關(guān)系是完全相同的，但展示的位置是不一樣的。這個功能，其實我很早就已經(jīng)間接實現(xiàn)了。這個操作實現(xiàn)，其實是一件比較...
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基因組重測序數(shù)據(jù)分析腳本
生成的文件說明： 1.~/Process/fastqc_result 用于存放質(zhì)量評估的結(jié)果2.~/Process/trim_out 用于存放過濾的結(jié)果3.~/Process...
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如果你是程序員，或者有一顆喜歡寫程序的心，喜歡分享技術(shù)干貨、項目經(jīng)驗、程序員日常囧事等等，歡迎投稿《程序員》專題。 專題主編：小彤花園 http://www.itdecent.cn/users/4a4eb4feee62/ 【程序員】專題拒稿指北：http://www.itdecent.cn/p/7c8b33b5f63b 投稿須知： 1.收錄相關(guān)技術(shù)文章，但不限于技術(shù)，也可以是項目經(jīng)驗類的文章和程序員日常。 2.文章內(nèi)不得有任何推廣信息。包括但不限于公眾號、微博、微信，更不得在通過投稿后再修改文章加入推廣信息。你可以將這些推廣以及個人信息放在個人主頁介紹里。 3.字?jǐn)?shù)極少，段落混亂，大段代碼沒有放到代碼框的文章不收錄 4.不相關(guān)的內(nèi)容不收錄，請確認(rèn)文章內(nèi)容和本專題相關(guān) 目前針對優(yōu)質(zhì)作者及愛好者，開設(shè)了官方程序員微信群，希望加入請發(fā)簡信給主編小彤花園索取個人微信，主編會將你加入到【程序員】微信群，分享內(nèi)容，收獲知識。添加微信時備注昵稱。
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