前言 最近一直在看小麥表觀遺傳相關(guān)的文獻(xiàn),然后下載了文章中的數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,分析的流程大致跟網(wǎng)上教程相似,但是由于小麥基因組比較大(16G),研究不像人類,小鼠及一些模式植物廣...
前言 最近一直在看小麥表觀遺傳相關(guān)的文獻(xiàn),然后下載了文章中的數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,分析的流程大致跟網(wǎng)上教程相似,但是由于小麥基因組比較大(16G),研究不像人類,小鼠及一些模式植物廣...
前言 最近一直在看小麥表觀遺傳相關(guān)的文獻(xiàn),然后下載了文章中的數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,分析的流程大致跟網(wǎng)上教程相似,但是由于小麥基因組比較大(16G),研究不像人類,小鼠及一些模式植物廣...
搬運(yùn)工一枚,只為記錄學(xué)習(xí),原文出自https://www.sohu.com/a/204503028_761120,侵權(quán)即刪 這篇文章之前推送過(guò),但出現(xiàn)幾點(diǎn)瑕疵,應(yīng)廣大粉絲留言...
RepeatMasker是重復(fù)序列檢測(cè)的常用工具,通過(guò)與參考數(shù)據(jù)庫(kù)的相似性比對(duì)來(lái)準(zhǔn)確識(shí)別或屏蔽基因組中的重復(fù)序列,屬于同源預(yù)測(cè)注釋的方式。下文除了RepeatMasker的使...
RepeatMasker是重復(fù)序列檢測(cè)的常用工具,通過(guò)與參考數(shù)據(jù)庫(kù)的相似性比對(duì)來(lái)準(zhǔn)確識(shí)別或屏蔽基因組中的重復(fù)序列,屬于同源預(yù)測(cè)注釋的方式。下文除了RepeatMasker的使...
有時(shí)候conda莫名奇妙就會(huì)丟失一些庫(kù),幾周前運(yùn)行得好好的環(huán)境,卻在前天import torch的時(shí)候突然提示: 看提示發(fā)現(xiàn),這是個(gè)conda環(huán)境,卻調(diào)用了系統(tǒng)庫(kù)。我確信我在...
寫在前面 進(jìn)行轉(zhuǎn)換 原始圖片 X軸-翻轉(zhuǎn) X軸-翻轉(zhuǎn),Y軸-翻轉(zhuǎn) X軸與Y軸調(diào)換 X軸與Y軸調(diào)換 Y軸翻轉(zhuǎn) X軸與Y軸調(diào)換 X軸翻轉(zhuǎn) X軸與Y軸調(diào)換 X軸-翻轉(zhuǎn) Y軸-翻轉(zhuǎn)
寫在前面 以前總看到問(wèn)題是,基因結(jié)構(gòu)可視化的問(wèn)題;現(xiàn)在則變成了啟動(dòng)子元件的預(yù)測(cè)或者說(shuō)可視化。這本身比較簡(jiǎn)單,也比較玄乎,所以我一直不是太樂意與別人討論。但學(xué)院今天斷網(wǎng),手上的...
寫在前面 正如上圖,左右其實(shí)都是一組數(shù)據(jù)出來(lái)的圖片,基因之間的聚類關(guān)系是完全相同的,但展示的位置是不一樣的。這個(gè)功能,其實(shí)我很早就已經(jīng)間接實(shí)現(xiàn)了。這個(gè)操作實(shí)現(xiàn),其實(shí)是一件比較...
生成的文件說(shuō)明: 1.~/Process/fastqc_result 用于存放質(zhì)量評(píng)估的結(jié)果2.~/Process/trim_out 用于存放過(guò)濾的結(jié)果3.~/Process...