@易安_736f 可以的，可以在數(shù)據(jù)中的類別名稱修改，或者在 facet 函數(shù)里面設(shè)置 labeller
R 數(shù)據(jù)可視化 —— ggplot2 分面前言 分面的作用是在一個頁面上自動放置多幅圖像，它先將數(shù)據(jù)劃分為多個不同的子集，然后分別將每個子數(shù)據(jù)集繪制到頁面的小圖形面板中。 ggplot2 有兩種分面類型： 網(wǎng)格型 —...
@YannC 不要對列進(jìn)行聚類和分割
R 數(shù)據(jù)可視化 —— 聚類熱圖 ComplexHeatmap(一)前言 使用 pheatmap 已經(jīng)能夠繪制滿足大多數(shù)要求的聚類熱圖了。 受 pheatmap 包的啟發(fā)，ComplexHeatmap 提供了對熱圖更多更靈活的控制，如多數(shù)據(jù)熱...
基于Hi-C數(shù)據(jù)的深層挖掘和多組學(xué)聯(lián)合分析已經(jīng)成為了三維基因組領(lǐng)域的重要組成部分。而工欲善其事必先利其器，夯實(shí)基礎(chǔ)方能壘砌高臺。染色質(zhì)構(gòu)象各個層級的識別和鑒定的準(zhǔn)確性會直接影...
@4d47ba4ad5b2 版本不對啊，3.6是多少年前的版本了
TCGA 數(shù)據(jù)分析實(shí)戰(zhàn) —— 干性指數(shù)（mRNAsi、mDNAsi）前言 干細(xì)胞(stem cells, SC)是人體內(nèi)具有自我復(fù)制和多向分化潛能的原始細(xì)胞，而這種自我更新和分化為成熟細(xì)胞的能力稱為干性 腫瘤干細(xì)胞 (cancer stem ...
@里卡 0.1 太小了，0.5 試試吧
TCGA 數(shù)據(jù)分析實(shí)戰(zhàn) —— GSVA、ssGSEA 和單基因富集分析前言 前面，我們介紹過了差異基因的功能富集分析，今天，我們對這部分的內(nèi)容作一些補(bǔ)充 主要介紹一下 GEVA、ssGSEA 和單基因的富集分析 GSVA 我們知道，GSEA 富...
@里卡 model.RNA <- gelnet(X.sc, NULL, 0, 1) 這步才是構(gòu)建模型
TCGA 數(shù)據(jù)分析實(shí)戰(zhàn) —— 干性指數(shù)（mRNAsi、mDNAsi）前言 干細(xì)胞(stem cells, SC)是人體內(nèi)具有自我復(fù)制和多向分化潛能的原始細(xì)胞，而這種自我更新和分化為成熟細(xì)胞的能力稱為干性 腫瘤干細(xì)胞 (cancer stem ...
@煙塵花鎖眉 目前沒看到過
R 數(shù)據(jù)可視化 —— 用 gtable 繪制多個 Y 軸前言 經(jīng)過前面一節(jié)的介紹，我們對 gtable 布局應(yīng)該有了較為清晰的認(rèn)識，下面讓我們來看看 ggplot 對象的布局 首先，使用 ggplot 創(chuàng)建一個圖形 獲取 ggpl...
前言 不是在幫人解決問題，就是在解決問題的路上~~~。 之前所介紹的熱圖，其每個顏色塊都是一個矩形，而今天要介紹的是如何繪制對角線分割熱圖。也就是每個顏色塊矩形被對角線分割為...
前言 上一節(jié)所介紹的繪制多個 Y 軸，只能在圖形的右側(cè)依次添加 Y 軸。 在 Y 軸數(shù)量過多的情況下（當(dāng)然，軸不應(yīng)該太多），將軸平均地放置在左右兩側(cè)會更美觀些。 因此，這節(jié)主...
前言 經(jīng)過前面一節(jié)的介紹，我們對 gtable 布局應(yīng)該有了較為清晰的認(rèn)識，下面讓我們來看看 ggplot 對象的布局 首先，使用 ggplot 創(chuàng)建一個圖形 獲取 ggpl...
前言 多次有人問我，如何使用 R 來繪制多個 Y 軸。那我就研究了下，稍微介紹一下學(xué)習(xí)所得。 當(dāng)我們需要展示的數(shù)據(jù)，包含相同的 X 軸，但是具有兩個不同的 Y 軸變量時，我們...
接上一節(jié)內(nèi)容，這一節(jié)主要介紹 ggforce 提供的分組注釋以及分面功能 3. 分組注釋 ggforce 提供了一個很方便的分組注釋功能。例如，我們想展示不同種類的鳶尾花在花...
@涅槃_f733 是
TCGA 數(shù)據(jù)分析實(shí)戰(zhàn) —— 干性指數(shù)（mRNAsi、mDNAsi）前言 干細(xì)胞(stem cells, SC)是人體內(nèi)具有自我復(fù)制和多向分化潛能的原始細(xì)胞，而這種自我更新和分化為成熟細(xì)胞的能力稱為干性 腫瘤干細(xì)胞 (cancer stem ...
接上一節(jié)內(nèi)容，繼續(xù)介紹 ggforce 包的使用 2. 線條 線條一般用來連接點(diǎn)或作為路徑，線條的種類有很多，每種類型的線條提供了不同版本的函數(shù)，可以用來設(shè)置線條的漸變色、線...
前言 ggforce 是 ggplot2 的一個擴(kuò)展包，提供了許多自定義的工具函數(shù)，可以更方便地為圖形添加不同的形狀、線條等注釋，更靈活的分面圖形繪制 使用 安裝使用 1. ...
前言 ggpol 是 ggplot2 的一個擴(kuò)展包，添加了一些圖形。主要可以繪制 parliament diagrams（議會圖），也可以方便的繪制金字塔圖，以及箱線圖和散點(diǎn)...
