轉自個人微信公粽號【易學統(tǒng)計】的統(tǒng)計學習筆記：R語言：兩因素重復測量方差分析[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzU4MjgyODQzNw=...
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R語言|兩因素重復測量方差分析 -
單細胞轉錄組揭示視網膜細胞異質性A single-cell transcriptome atlas of the adult human retina 遺傳性視網膜疾病正成為成人失明的主要原因，當前已鑒定到...
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Step-by-Step:使用R語言進行斷點回歸(RDD)分析1. 簡介 斷點回歸（Regression Discontinuity）適用于以下情形：人群是否接受干預（Treatment）是依據某一數(shù)值變量（rating variabl...
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RNA-seq下游分析（3）-rawcount轉換為TPM及RPKM格式
因為我用的GTF文件較新，為realease101版本，因此需要自己生成轉換文件需要的TxDb文件，首先需要安裝GenomicFeatures包，然后直接在線應用命令進行數(shù)據...
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轉錄組時間序列數(shù)據處理針對轉錄組數(shù)據，平時分析中最常見兩組之間的比較，比如不同處理或者不同突變體。面對這樣的數(shù)據用用 DESeq2 或者 edgeR 基本就差不多。如果樣本量或者不同條件很多的話可...
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套路老掉牙，但是也得學學：lncRNA–miRNA–mRNA調控網絡預測
今天給大家分享一篇與lncRNA–miRNA–mRNA調控網絡預測相關、發(fā)表在Journal of Cancer Research and Clinical Oncology...
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【R>>Mfuzz】時間序列分析時間序列分析：對不同時間點（狀態(tài)）轉錄組或蛋白表達譜數(shù)據，進行模糊c均值聚類（fuzzy c-means clustering, FCM），找出具有相似表達模式的基因或蛋白并...
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2021-04-10 RNA-seq批次效應
批次效應指樣品在不同的批次處理和測量時引入的與生物狀態(tài)不相關的系統(tǒng)性的技術偏差。很多因素都可能導致批次效應的產生，如不同實驗條件、不同操作者、不同公司的試劑、不同批的試劑、實...
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airway數(shù)據集探索airway數(shù)據集的下載 airway數(shù)據集簡介 airway數(shù)據集是人平滑肌細胞的RNA-seq測序的原始counts數(shù)據。 airway數(shù)據集探索 colData 這一列...
